More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4816 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  75.93 
 
 		 488 aa  767    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 		 484 aa  989    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  56.39 
 
 		 493 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  55.69 
 
 		 494 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  55.69 
 
 		 491 aa  534  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  55.37 
 
 		 486 aa  535  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  54.34 
 
 		 478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  54.66 
 
 		 478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  54.45 
 
 		 478 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  54.45 
 
 		 478 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  53.93 
 
 		 478 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  53.18 
 
 		 486 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  54.24 
 
 		 490 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  49.58 
 
 		 485 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.48 
 
 		 491 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.17 
 
 		 487 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  50.1 
 
 		 493 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  49.27 
 
 		 504 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  49.58 
 
 		 493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  49.18 
 
 		 487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  49.58 
 
 		 493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  49.58 
 
 		 493 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.27 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.85 
 
 		 493 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.48 
 
 		 493 aa  445  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.85 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.37 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.76 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.27 
 
 		 493 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  45.91 
 
 		 481 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.64 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.44 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.64 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.17 
 
 		 493 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.08 
 
 		 479 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.36 
 
 		 499 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  48.25 
 
 		 494 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  47.39 
 
 		 475 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.16 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.16 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  47.39 
 
 		 475 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  47.39 
 
 		 475 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.13 
 
 		 499 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  47.14 
 
 		 493 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  47.39 
 
 		 475 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.81 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.09 
 
 		 493 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.12 
 
 		 490 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.08 
 
 		 532 aa  313  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  35.15 
 
 		 530 aa  292  8e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  35.78 
 
 		 533 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.45 
 
 		 534 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.59 
 
 		 528 aa  277  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  34.02 
 
 		 1076 aa  273  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.44 
 
 		 533 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  34.59 
 
 		 530 aa  270  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.02 
 
 		 534 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  36.64 
 
 		 522 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.25 
 
 		 547 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.51 
 
 		 545 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.07 
 
 		 529 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.15 
 
 		 532 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  33.77 
 
 		 558 aa  239  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.14 
 
 		 565 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.25 
 
 		 525 aa  234  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  32.87 
 
 		 499 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.39 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  34.05 
 
 		 848 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.91 
 
 		 529 aa  226  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.78 
 
 		 651 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  29.84 
 
 		 487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  32.18 
 
 		 546 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  31.96 
 
 		 533 aa  219  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  30.59 
 
 		 557 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.44 
 
 		 507 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.54 
 
 		 511 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  31.51 
 
 		 539 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.62 
 
 		 531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  29.38 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  38.8 
 
 		 534 aa  182  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  27.43 
 
 		 523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.68 
 
 		 527 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  30.14 
 
 		 558 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  34.52 
 
 		 589 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  28.57 
 
 		 528 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.52 
 
 		 548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  26.68 
 
 		 579 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  27.23 
 
 		 586 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  35.96 
 
 		 581 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  32.26 
 
 		 534 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  31.31 
 
 		 582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  27.83 
 
 		 574 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  40.09 
 
 		 560 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  38.79 
 
 		 588 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  36.02 
 
 		 589 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  32.61 
 
 		 581 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  37.44 
 
 		 556 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  34.6 
 
 		 577 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  38.12 
 
 		 583 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  36.52 
 
 		 590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>