More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3836 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  100 
 
 
1076 aa  2188    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  51.67 
 
 
651 aa  554  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  43.68 
 
 
565 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  41.81 
 
 
533 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.36 
 
 
528 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.85 
 
 
533 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.61 
 
 
532 aa  372  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  37.43 
 
 
530 aa  369  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.67 
 
 
548 aa  364  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  38.52 
 
 
530 aa  355  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.03 
 
 
545 aa  346  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  38.83 
 
 
487 aa  344  7e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  36.23 
 
 
522 aa  338  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.84 
 
 
547 aa  329  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  36.51 
 
 
558 aa  328  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  34.33 
 
 
533 aa  316  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.17 
 
 
532 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.17 
 
 
534 aa  315  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  35.25 
 
 
534 aa  313  1e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.66 
 
 
529 aa  305  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  34.58 
 
 
557 aa  301  4e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.98 
 
 
531 aa  300  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.33 
 
 
525 aa  295  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.84 
 
 
529 aa  291  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.15 
 
 
534 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.27 
 
 
546 aa  288  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.24 
 
 
516 aa  275  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.08 
 
 
484 aa  273  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.88 
 
 
527 aa  272  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  33.45 
 
 
539 aa  268  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  31.92 
 
 
534 aa  267  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  33.71 
 
 
481 aa  266  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  33.4 
 
 
485 aa  265  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  33.45 
 
 
493 aa  265  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.19 
 
 
494 aa  262  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  32.64 
 
 
493 aa  260  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  32.64 
 
 
493 aa  260  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  32.64 
 
 
493 aa  260  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.33 
 
 
477 aa  258  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.4 
 
 
488 aa  258  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.58 
 
 
493 aa  258  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.94 
 
 
511 aa  255  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  32.39 
 
 
475 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  32.39 
 
 
475 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  32.39 
 
 
475 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  32.39 
 
 
475 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.39 
 
 
493 aa  255  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  32.46 
 
 
504 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  32.26 
 
 
493 aa  253  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.2 
 
 
493 aa  253  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.2 
 
 
493 aa  253  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.2 
 
 
493 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.2 
 
 
493 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.15 
 
 
491 aa  252  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  33.77 
 
 
490 aa  251  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  32.9 
 
 
480 aa  250  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.02 
 
 
486 aa  250  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.52 
 
 
487 aa  249  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.02 
 
 
493 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.77 
 
 
493 aa  248  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2094  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  37.35 
 
 
531 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  29.63 
 
 
589 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.89 
 
 
493 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0604  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.8 
 
 
535 aa  244  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  32.84 
 
 
487 aa  243  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  30.68 
 
 
523 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.66 
 
 
494 aa  239  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.66 
 
 
494 aa  239  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  33.14 
 
 
486 aa  239  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.33 
 
 
499 aa  238  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.57 
 
 
495 aa  238  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  32.66 
 
 
494 aa  238  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.27 
 
 
479 aa  234  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  32.89 
 
 
493 aa  233  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.02 
 
 
478 aa  230  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.65 
 
 
478 aa  230  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.84 
 
 
478 aa  229  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.08 
 
 
493 aa  228  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.31 
 
 
499 aa  224  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.84 
 
 
478 aa  224  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.57 
 
 
490 aa  223  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.84 
 
 
478 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.63 
 
 
491 aa  219  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0279  D-alanyl-D-alaninecarboxypeptidase/D-alanyl-D- al anine-endopeptidase  33.4 
 
 
554 aa  219  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.87 
 
 
499 aa  214  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  30.93 
 
 
848 aa  212  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6230  peptidase S13 D-Ala-D-Ala carboxypeptidase C  31.53 
 
 
544 aa  210  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.82 
 
 
507 aa  205  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5171  D-alanyl-D-alaninecarboxypeptidase/D-alanyl-D- alanine-endopeptidase  32.56 
 
 
517 aa  204  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.133216  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4495  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.21 
 
 
518 aa  200  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  29.32 
 
 
456 aa  199  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  30.94 
 
 
620 aa  186  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1558  hypothetical protein  31.3 
 
 
548 aa  185  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  29.73 
 
 
528 aa  185  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1426  hypothetical protein  30.53 
 
 
548 aa  180  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  26.77 
 
 
481 aa  171  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1876  D-alanyl-D-alaninecarboxypeptidase/D-alanyl-D- al anine-endopeptidase  29.56 
 
 
497 aa  171  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2539  peptidase S13 D-Ala-D-Ala carboxypeptidase C  31.19 
 
 
538 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  28.79 
 
 
560 aa  153  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  27.2 
 
 
558 aa  148  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>