258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0978 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 		 488 aa  998    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  75.93 
 
 		 484 aa  767    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  58.42 
 
 		 486 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  58.04 
 
 		 494 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  57.76 
 
 		 493 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  56.96 
 
 		 491 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  58.16 
 
 		 490 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  55.49 
 
 		 478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  55.69 
 
 		 478 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  55.81 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  55.49 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  55.39 
 
 		 478 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  54.47 
 
 		 486 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  49.16 
 
 		 485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.9 
 
 		 493 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.12 
 
 		 491 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  50.1 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.71 
 
 		 479 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  49.9 
 
 		 493 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  50.1 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  50.1 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.07 
 
 		 487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  47.17 
 
 		 481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  47.59 
 
 		 504 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.85 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.27 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.85 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.85 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.85 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.85 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  47.39 
 
 		 480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.43 
 
 		 493 aa  445  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.06 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.75 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  47.96 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.48 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  48.37 
 
 		 487 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.57 
 
 		 499 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.02 
 
 		 475 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.02 
 
 		 475 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.02 
 
 		 475 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  48.02 
 
 		 475 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.02 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.7 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  47.54 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.83 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.83 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.7 
 
 		 490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.72 
 
 		 532 aa  319  6e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  36.05 
 
 		 530 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  37.31 
 
 		 533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.1 
 
 		 533 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.21 
 
 		 534 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.84 
 
 		 528 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.52 
 
 		 534 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  33.59 
 
 		 530 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.76 
 
 		 547 aa  266  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  35.7 
 
 		 522 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.07 
 
 		 516 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.27 
 
 		 534 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  33.4 
 
 		 1076 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.16 
 
 		 545 aa  256  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.52 
 
 		 529 aa  256  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  33.95 
 
 		 558 aa  253  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.81 
 
 		 529 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.02 
 
 		 565 aa  246  8e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.63 
 
 		 525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  32.48 
 
 		 557 aa  241  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  33.77 
 
 		 533 aa  240  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.25 
 
 		 499 aa  240  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.21 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  32.5 
 
 		 546 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  32.68 
 
 		 848 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  35.02 
 
 		 507 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.48 
 
 		 651 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  32.33 
 
 		 539 aa  217  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.33 
 
 		 531 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.06 
 
 		 511 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  32.26 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  30.32 
 
 		 558 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  27.56 
 
 		 534 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  37.85 
 
 		 487 aa  169  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  29.54 
 
 		 528 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.9 
 
 		 548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  27.41 
 
 		 523 aa  161  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  28.93 
 
 		 556 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.81 
 
 		 527 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  32.81 
 
 		 589 aa  153  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  28.77 
 
 		 560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  36.67 
 
 		 582 aa  146  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  27.01 
 
 		 580 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  28 
 
 		 581 aa  139  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  28.35 
 
 		 575 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  35.37 
 
 		 581 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  26.84 
 
 		 481 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  33.65 
 
 		 620 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  39.09 
 
 		 583 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  39.6 
 
 		 574 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  38.2 
 
 		 588 aa  123  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  36.33 
 
 		 590 aa  123  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>