182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4195 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  88.26 
 
 		 494 aa  886    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 		 494 aa  1012    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  69.92 
 
 		 487 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  68.53 
 
 		 493 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  66.94 
 
 		 493 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  68.53 
 
 		 493 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.83 
 
 		 493 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  70.6 
 
 		 487 aa  696    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  66.74 
 
 		 493 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  67.35 
 
 		 493 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  68.62 
 
 		 493 aa  670    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  66.74 
 
 		 493 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  67.35 
 
 		 493 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  67.71 
 
 		 493 aa  658    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  68.53 
 
 		 493 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  68.53 
 
 		 493 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  100 
 
 		 494 aa  1012    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  69.06 
 
 		 495 aa  669    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  67.76 
 
 		 493 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  66.25 
 
 		 475 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  66.25 
 
 		 475 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  66.25 
 
 		 475 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  66.25 
 
 		 475 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  63.39 
 
 		 504 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  63.83 
 
 		 491 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  63.6 
 
 		 485 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  62 
 
 		 480 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  61.38 
 
 		 479 aa  594  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  58.66 
 
 		 481 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  57.97 
 
 		 499 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  49.08 
 
 		 493 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.16 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  48.26 
 
 		 499 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.83 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  46.07 
 
 		 493 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  46.78 
 
 		 477 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.76 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  44.61 
 
 		 486 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.23 
 
 		 491 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  46.6 
 
 		 490 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.55 
 
 		 478 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  45.55 
 
 		 478 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  49.3 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  50.12 
 
 		 490 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  44.4 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  44.19 
 
 		 478 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  43.12 
 
 		 494 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  44.03 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.52 
 
 		 532 aa  295  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  36.16 
 
 		 533 aa  274  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.44 
 
 		 499 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  34.9 
 
 		 848 aa  255  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.9 
 
 		 528 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.01 
 
 		 651 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  32.34 
 
 		 534 aa  247  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.83 
 
 		 533 aa  246  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.76 
 
 		 525 aa  244  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  32.39 
 
 		 530 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  33.33 
 
 		 522 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  32.02 
 
 		 530 aa  243  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.46 
 
 		 534 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  32.66 
 
 		 1076 aa  239  8e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  31.42 
 
 		 487 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.83 
 
 		 529 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 533 aa  233  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  33.4 
 
 		 558 aa  233  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.47 
 
 		 547 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.75 
 
 		 534 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.69 
 
 		 516 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.71 
 
 		 545 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.89 
 
 		 529 aa  220  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  30.99 
 
 		 557 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.91 
 
 		 565 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.09 
 
 		 532 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  30.36 
 
 		 546 aa  207  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  33.15 
 
 		 539 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.11 
 
 		 511 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.28 
 
 		 527 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  29.22 
 
 		 523 aa  193  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.41 
 
 		 531 aa  184  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  32.57 
 
 		 620 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  30.04 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  29.96 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  27.88 
 
 		 534 aa  161  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08310  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  29.11 
 
 		 558 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.575602  normal  0.0585768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  28.91 
 
 		 481 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  27.82 
 
 		 528 aa  130  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  35.52 
 
 		 589 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  25.56 
 
 		 493 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  25.25 
 
 		 578 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.27 
 
 		 548 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  31.54 
 
 		 577 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  31.6 
 
 		 556 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  35.15 
 
 		 582 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  32.67 
 
 		 583 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  29.56 
 
 		 581 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  32.22 
 
 		 570 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  38 
 
 		 588 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  31.78 
 
 		 566 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  35.15 
 
 		 560 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>