227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1019 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  56.6 
 
 		 584 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  68.25 
 
 		 611 aa  823    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1191    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  55.92 
 
 		 700 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  55.92 
 
 		 584 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  55.92 
 
 		 584 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  55.54 
 
 		 588 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  55.54 
 
 		 699 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  55.54 
 
 		 588 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  53.94 
 
 		 598 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  53.94 
 
 		 598 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  55.21 
 
 		 604 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  53.6 
 
 		 598 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  42.71 
 
 		 579 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0027  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  56.72 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3313  hypothetical protein  52.68 
 
 		 339 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  32.6 
 
 		 629 aa  279  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2936  hypothetical protein  44.17 
 
 		 207 aa  183  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172579  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  31.42 
 
 		 588 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0029  hypothetical protein  54.32 
 
 		 166 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  30.2 
 
 		 556 aa  158  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  27.18 
 
 		 582 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  29.8 
 
 		 560 aa  140  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  29.02 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  28.89 
 
 		 567 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  27.14 
 
 		 580 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  29.11 
 
 		 579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  30.77 
 
 		 577 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  26.01 
 
 		 583 aa  126  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  28.38 
 
 		 580 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  27.52 
 
 		 570 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  25.99 
 
 		 534 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  27.44 
 
 		 577 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  27.53 
 
 		 574 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  25.61 
 
 		 590 aa  120  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  27.41 
 
 		 575 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  26.59 
 
 		 587 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  27.38 
 
 		 566 aa  117  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  27.64 
 
 		 589 aa  117  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  26.62 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  26.62 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  26.62 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  26.2 
 
 		 581 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  26.78 
 
 		 578 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  25.63 
 
 		 586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  27.81 
 
 		 579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  25.63 
 
 		 586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  25.63 
 
 		 586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  26.78 
 
 		 569 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  27.91 
 
 		 533 aa  110  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  27.08 
 
 		 581 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  25.59 
 
 		 582 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  25.41 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  37.19 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  26.25 
 
 		 587 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  26.83 
 
 		 578 aa  102  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  36.45 
 
 		 490 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  25.92 
 
 		 574 aa  100  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  33.5 
 
 		 481 aa  99.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  35.86 
 
 		 558 aa  97.8  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35 
 
 		 491 aa  97.4  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.91 
 
 		 532 aa  97.1  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  32.84 
 
 		 487 aa  97.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  33.66 
 
 		 504 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  33.66 
 
 		 601 aa  95.1  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  25 
 
 		 578 aa  94.7  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33 
 
 		 491 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.23 
 
 		 477 aa  93.2  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  25.05 
 
 		 546 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  23.45 
 
 		 579 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.66 
 
 		 488 aa  91.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  30.98 
 
 		 586 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.2 
 
 		 487 aa  91.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.57 
 
 		 529 aa  91.3  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.33 
 
 		 499 aa  90.9  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  32.49 
 
 		 493 aa  90.9  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  25.23 
 
 		 572 aa  90.9  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.44 
 
 		 529 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  25.84 
 
 		 534 aa  89  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.03 
 
 		 528 aa  88.6  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.84 
 
 		 486 aa  88.6  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  30.73 
 
 		 485 aa  87  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.76 
 
 		 478 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.76 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.76 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.88 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.47 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.61 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.31 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  23.88 
 
 		 589 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.91 
 
 		 525 aa  82.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  24.13 
 
 		 530 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.66 
 
 		 533 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.85 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.03 
 
 		 493 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.35 
 
 		 493 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  30.73 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.35 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.35 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>