More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0688 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  100 
 
 		 572 aa  1169    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  55.01 
 
 		 578 aa  634  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  54.04 
 
 		 566 aa  580  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  53.33 
 
 		 579 aa  579  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  50.61 
 
 		 577 aa  571  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  48.16 
 
 		 579 aa  556  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  51.5 
 
 		 574 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  48.86 
 
 		 583 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  49.48 
 
 		 574 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  50.44 
 
 		 575 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  48.07 
 
 		 587 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  48.26 
 
 		 581 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  49.38 
 
 		 581 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  48.16 
 
 		 570 aa  541  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  49.83 
 
 		 586 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  48.31 
 
 		 569 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  48.55 
 
 		 586 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  48.55 
 
 		 586 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  49.03 
 
 		 580 aa  538  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  48.55 
 
 		 586 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  50.09 
 
 		 573 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  50.27 
 
 		 573 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  50.27 
 
 		 573 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  46.53 
 
 		 579 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  47.19 
 
 		 578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  47.34 
 
 		 601 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  47.44 
 
 		 589 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  44.96 
 
 		 590 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  46.43 
 
 		 578 aa  511  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  44.48 
 
 		 582 aa  508  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  47.12 
 
 		 587 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  41.51 
 
 		 567 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  33.68 
 
 		 560 aa  279  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  33.1 
 
 		 556 aa  262  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  30.76 
 
 		 560 aa  259  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 588 aa  229  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  29.04 
 
 		 580 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 582 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  27.68 
 
 		 577 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.52 
 
 		 565 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.47 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  26.76 
 
 		 530 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.17 
 
 		 547 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  25.64 
 
 		 558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.22 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.09 
 
 		 545 aa  109  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  24.66 
 
 		 534 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.8 
 
 		 486 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  30.21 
 
 		 485 aa  103  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.97 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  31.01 
 
 		 504 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.35 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.86 
 
 		 491 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  25.52 
 
 		 493 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  25.52 
 
 		 493 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  25.52 
 
 		 493 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  31.25 
 
 		 494 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  23.94 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.9 
 
 		 499 aa  99.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  26.1 
 
 		 522 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  22.74 
 
 		 533 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  25.08 
 
 		 611 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.15 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  34.5 
 
 		 486 aa  97.4  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.68 
 
 		 532 aa  96.7  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  29.52 
 
 		 493 aa  96.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.47 
 
 		 478 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  26.55 
 
 		 629 aa  95.5  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.74 
 
 		 491 aa  94.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.59 
 
 		 493 aa  94  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  24.91 
 
 		 493 aa  94  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.41 
 
 		 494 aa  93.6  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.34 
 
 		 488 aa  93.6  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.41 
 
 		 494 aa  93.6  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  29.47 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  25.52 
 
 		 475 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  25.52 
 
 		 475 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  25.52 
 
 		 475 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  22.13 
 
 		 528 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  25.52 
 
 		 475 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.47 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  34.18 
 
 		 490 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.87 
 
 		 493 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.6 
 
 		 478 aa  91.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.47 
 
 		 478 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.87 
 
 		 493 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.87 
 
 		 493 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.42 
 
 		 495 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.42 
 
 		 493 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  25.3 
 
 		 533 aa  90.1  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.57 
 
 		 493 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  29.74 
 
 		 487 aa  90.1  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  25.05 
 
 		 587 aa  89.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.47 
 
 		 487 aa  88.6  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  26.44 
 
 		 1076 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.5 
 
 		 477 aa  87.8  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.84 
 
 		 493 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.84 
 
 		 493 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  26.12 
 
 		 598 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.73 
 
 		 493 aa  87  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>