205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5309 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  72.01 
 
 
586 aa  852    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  100 
 
 
586 aa  1184    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  100 
 
 
586 aa  1184    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  72.74 
 
 
587 aa  861    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  100 
 
 
586 aa  1184    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  50.43 
 
 
579 aa  574  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  49.66 
 
 
579 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  49.23 
 
 
569 aa  545  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  49.23 
 
 
587 aa  535  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  48.55 
 
 
572 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  48.12 
 
 
582 aa  521  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  46.59 
 
 
581 aa  510  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  45.81 
 
 
578 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  45.64 
 
 
583 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  46.94 
 
 
579 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  44.73 
 
 
578 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  46.68 
 
 
566 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  42.69 
 
 
590 aa  478  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  42.37 
 
 
581 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  45.62 
 
 
601 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  44.41 
 
 
570 aa  465  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  43.71 
 
 
577 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  43.56 
 
 
578 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  41.47 
 
 
574 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  42.61 
 
 
575 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  42.66 
 
 
574 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  41.6 
 
 
589 aa  425  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  42.15 
 
 
580 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  41.1 
 
 
573 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  41.1 
 
 
573 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  41.1 
 
 
573 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  42.35 
 
 
567 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  34.63 
 
 
560 aa  310  5e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  37.23 
 
 
560 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  33.45 
 
 
556 aa  279  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  32.71 
 
 
588 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  29.9 
 
 
577 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  28.81 
 
 
582 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30 
 
 
547 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  27.21 
 
 
534 aa  143  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.03 
 
 
533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  38.53 
 
 
580 aa  133  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.88 
 
 
545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  27.2 
 
 
530 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.22 
 
 
494 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.02 
 
 
486 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.91 
 
 
528 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  38.61 
 
 
493 aa  126  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.09 
 
 
532 aa  124  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  27.11 
 
 
611 aa  122  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  39.9 
 
 
486 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  25.27 
 
 
579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.89 
 
 
529 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.56 
 
 
532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  41.29 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  27.75 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  25.41 
 
 
584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  25.41 
 
 
584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  25.65 
 
 
700 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  25.24 
 
 
588 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.78 
 
 
488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.47 
 
 
529 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  26.46 
 
 
1076 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  25.04 
 
 
584 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  25.08 
 
 
588 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  25.32 
 
 
699 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.79 
 
 
565 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.84 
 
 
484 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.98 
 
 
491 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  34.31 
 
 
534 aa  107  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.35 
 
 
491 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  25.45 
 
 
587 aa  106  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  24.47 
 
 
589 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  26 
 
 
598 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  26 
 
 
598 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.3 
 
 
478 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  25.84 
 
 
598 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  30.13 
 
 
530 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  27.85 
 
 
533 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.65 
 
 
477 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  32.67 
 
 
504 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  34.62 
 
 
533 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  24.34 
 
 
557 aa  100  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  26.81 
 
 
485 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.31 
 
 
478 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33 
 
 
493 aa  100  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.31 
 
 
478 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.31 
 
 
478 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  24.72 
 
 
604 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.31 
 
 
478 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  37.12 
 
 
558 aa  97.8  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.29 
 
 
487 aa  95.1  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  29.11 
 
 
487 aa  94  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  32 
 
 
493 aa  93.6  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  25.56 
 
 
546 aa  94  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  32 
 
 
493 aa  93.6  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  32 
 
 
493 aa  93.6  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  32 
 
 
493 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32.5 
 
 
499 aa  91.3  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  32 
 
 
493 aa  91.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>