193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12927 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  57.8 
 
 
588 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  58.19 
 
 
700 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  58.19 
 
 
584 aa  666    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  56.62 
 
 
598 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  56.62 
 
 
598 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  55.52 
 
 
604 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  57.8 
 
 
699 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  58.19 
 
 
584 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  56.02 
 
 
598 aa  659    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  58.19 
 
 
584 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  57.8 
 
 
588 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  68.25 
 
 
587 aa  810    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  100 
 
 
611 aa  1234    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  44.82 
 
 
579 aa  521  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0027  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  59.8 
 
 
418 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3313  hypothetical protein  56.5 
 
 
339 aa  360  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  32.86 
 
 
629 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  32.9 
 
 
588 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0029  hypothetical protein  54.55 
 
 
166 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2936  hypothetical protein  44.17 
 
 
207 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  30.41 
 
 
560 aa  161  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  29.01 
 
 
582 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  29.4 
 
 
556 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  27.64 
 
 
583 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  27.88 
 
 
567 aa  141  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  28.31 
 
 
579 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  28.29 
 
 
575 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  28.73 
 
 
560 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  27.76 
 
 
574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  28.33 
 
 
580 aa  133  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  28.55 
 
 
569 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  28.8 
 
 
577 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  26.51 
 
 
578 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  28.39 
 
 
601 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1432  hypothetical protein  27.56 
 
 
582 aa  127  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1738  amidohydrolase 3  27.26 
 
 
580 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.363684  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  26.75 
 
 
570 aa  124  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2680  amidohydrolase 3  26.23 
 
 
579 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  26.97 
 
 
573 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  27.11 
 
 
586 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  26.97 
 
 
573 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  27.11 
 
 
586 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  26.97 
 
 
573 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  27.11 
 
 
586 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  34.92 
 
 
577 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  26.89 
 
 
581 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  24.63 
 
 
534 aa  120  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  25.65 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  25.55 
 
 
581 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  27.21 
 
 
587 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  26.9 
 
 
533 aa  117  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  25.96 
 
 
578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  36 
 
 
590 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  28.23 
 
 
589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.64 
 
 
491 aa  114  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  26.76 
 
 
574 aa  114  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  26.33 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  25.36 
 
 
579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  35.86 
 
 
481 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  38 
 
 
578 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  38.19 
 
 
486 aa  109  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.82 
 
 
493 aa  108  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.32 
 
 
493 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.32 
 
 
493 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.82 
 
 
493 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.37 
 
 
486 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.37 
 
 
493 aa  105  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.25 
 
 
532 aa  104  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.83 
 
 
493 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  36.45 
 
 
487 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.35 
 
 
494 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.83 
 
 
493 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.83 
 
 
493 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  35.96 
 
 
493 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  26.6 
 
 
534 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.98 
 
 
487 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  35.64 
 
 
504 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  24.49 
 
 
530 aa  98.6  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.84 
 
 
477 aa  98.2  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  25.08 
 
 
572 aa  97.8  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.15 
 
 
499 aa  97.4  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  35.15 
 
 
485 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.65 
 
 
491 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.33 
 
 
488 aa  96.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  35.85 
 
 
490 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  36.87 
 
 
493 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  36.87 
 
 
493 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  36.87 
 
 
493 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  36.18 
 
 
493 aa  95.1  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  33.17 
 
 
566 aa  95.1  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.56 
 
 
493 aa  94  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  35.29 
 
 
494 aa  93.2  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40 
 
 
478 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40 
 
 
478 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40 
 
 
478 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.33 
 
 
495 aa  90.1  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40 
 
 
478 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.33 
 
 
484 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.69 
 
 
533 aa  87.4  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.75 
 
 
478 aa  87  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>