More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2093 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  100 
 
 		 568 aa  1145    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  42.69 
 
 		 585 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  34.06 
 
 		 456 aa  183  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  29.17 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  29.79 
 
 		 440 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  27.67 
 
 		 435 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  31.57 
 
 		 480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.54 
 
 		 445 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  28.66 
 
 		 666 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  27.73 
 
 		 433 aa  134  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  28.14 
 
 		 426 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  26.77 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  26.35 
 
 		 428 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  27.3 
 
 		 434 aa  127  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  26.4 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  27.97 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  28.87 
 
 		 438 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  26.82 
 
 		 1084 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  30.09 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.21 
 
 		 430 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  26.14 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  25.68 
 
 		 444 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.71 
 
 		 407 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.06 
 
 		 433 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  25.75 
 
 		 431 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  27.84 
 
 		 426 aa  117  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  27.73 
 
 		 686 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  28.44 
 
 		 448 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  27.61 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.5 
 
 		 459 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  29 
 
 		 511 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  26.24 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  25.46 
 
 		 543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  28.63 
 
 		 485 aa  114  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  26.33 
 
 		 470 aa  114  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  25.96 
 
 		 444 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  28.13 
 
 		 440 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  25.67 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  27.47 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  25.21 
 
 		 540 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  26.79 
 
 		 390 aa  111  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  26.44 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  27.06 
 
 		 680 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  28.44 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  25.85 
 
 		 397 aa  104  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  28.38 
 
 		 819 aa  104  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  23.01 
 
 		 529 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  24.1 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  26.87 
 
 		 1111 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  26.54 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  25.17 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  25.78 
 
 		 1067 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  25.39 
 
 		 1065 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  28.87 
 
 		 447 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  26.84 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  30.25 
 
 		 409 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  27.78 
 
 		 396 aa  100  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  24.22 
 
 		 446 aa  99.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  27.74 
 
 		 426 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  24.72 
 
 		 1062 aa  99.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.22 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  24.48 
 
 		 438 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  25.97 
 
 		 419 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  30.02 
 
 		 409 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  30.02 
 
 		 409 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  24.54 
 
 		 672 aa  97.4  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  23.09 
 
 		 1066 aa  97.4  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  23.45 
 
 		 430 aa  97.1  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  24.94 
 
 		 1071 aa  96.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  25.76 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  26.05 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  25.93 
 
 		 440 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  26.71 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  26.77 
 
 		 419 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  28.14 
 
 		 381 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  24.22 
 
 		 598 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  28.29 
 
 		 1062 aa  94.4  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.15 
 
 		 426 aa  94  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  25.17 
 
 		 411 aa  94  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  25.17 
 
 		 428 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  23.61 
 
 		 401 aa  93.6  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  26.71 
 
 		 419 aa  93.6  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  25.71 
 
 		 416 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  24.22 
 
 		 1062 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  24.19 
 
 		 413 aa  93.2  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  24.94 
 
 		 443 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  26.23 
 
 		 423 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  27.56 
 
 		 1113 aa  92.8  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  22.1 
 
 		 1060 aa  92.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  27.89 
 
 		 445 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  23.99 
 
 		 1062 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  21.6 
 
 		 441 aa  92  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  25.23 
 
 		 412 aa  92  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  24.89 
 
 		 411 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  23.77 
 
 		 1062 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  23.77 
 
 		 1081 aa  91.3  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  28.77 
 
 		 413 aa  90.5  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  28.77 
 
 		 413 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  23.58 
 
 		 1062 aa  89  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>