194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3085 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  100 
 
 		 694 aa  1420    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  44.46 
 
 		 692 aa  610  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  41.58 
 
 		 702 aa  549  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  35.29 
 
 		 686 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  34.57 
 
 		 672 aa  339  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  34.2 
 
 		 680 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  27.67 
 
 		 666 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  27.11 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  26.6 
 
 		 470 aa  123  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  26.77 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  24.94 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.21 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  23.68 
 
 		 496 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  25.17 
 
 		 511 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  25 
 
 		 451 aa  97.4  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  28.78 
 
 		 438 aa  95.1  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  23.82 
 
 		 455 aa  94  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  24.72 
 
 		 512 aa  91.7  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  24.88 
 
 		 1062 aa  90.9  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.59 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  23.52 
 
 		 478 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  23.01 
 
 		 438 aa  89  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  21.32 
 
 		 484 aa  87.4  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  24.28 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  25 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  26.34 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  26.23 
 
 		 1010 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.14 
 
 		 1081 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  24.07 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  23.38 
 
 		 1069 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  23.83 
 
 		 1005 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  22.51 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  23.32 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  22.59 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  25.66 
 
 		 1040 aa  74.3  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.55 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  25.33 
 
 		 1042 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  25.11 
 
 		 425 aa  72  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.53 
 
 		 1014 aa  72.4  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1042 aa  72  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  24.15 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  24.14 
 
 		 1078 aa  71.2  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  22.7 
 
 		 568 aa  70.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  22.63 
 
 		 1031 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  21.19 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  24.68 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  21.58 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  22.3 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  39.62 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  22.47 
 
 		 1062 aa  66.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  23.87 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  24.09 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  22.99 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  24.33 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  43.84 
 
 		 1060 aa  65.1  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  42.47 
 
 		 1062 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  38.61 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  22.81 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  42.47 
 
 		 598 aa  64.7  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  41.1 
 
 		 1049 aa  63.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  21.56 
 
 		 428 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  42.47 
 
 		 1062 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  23.69 
 
 		 433 aa  63.5  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  42.47 
 
 		 1062 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  42.47 
 
 		 1062 aa  63.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  23.85 
 
 		 436 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  23.71 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  41.1 
 
 		 1062 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  41.1 
 
 		 1062 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  41.1 
 
 		 1062 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  22.44 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  23.71 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  31.15 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  33.33 
 
 		 585 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  22.93 
 
 		 426 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  39.73 
 
 		 1067 aa  59.3  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  40 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  25.91 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  33.33 
 
 		 819 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  43.84 
 
 		 1113 aa  58.9  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  34.29 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  39.13 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  24.59 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  36.99 
 
 		 1066 aa  58.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  22.06 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  38.36 
 
 		 1065 aa  57.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  21.46 
 
 		 1059 aa  57.8  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  30.37 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  32.26 
 
 		 444 aa  56.6  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  23.33 
 
 		 409 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  23.85 
 
 		 411 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  23.33 
 
 		 409 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  34.96 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  23.33 
 
 		 409 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  33.33 
 
 		 419 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  22.25 
 
 		 423 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  33.04 
 
 		 351 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  28.75 
 
 		 451 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  20 
 
 		 540 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  43.84 
 
 		 1138 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>