More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2756 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  100 
 
 
403 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  59.31 
 
 
418 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  59.8 
 
 
461 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  51.59 
 
 
419 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  53.8 
 
 
425 aa  365  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  54.47 
 
 
409 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  50.25 
 
 
419 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  51.66 
 
 
412 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  51.46 
 
 
420 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  52.09 
 
 
413 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  52.09 
 
 
413 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  46.75 
 
 
405 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  52.09 
 
 
413 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  50.63 
 
 
436 aa  348  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  47.27 
 
 
408 aa  342  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  52.32 
 
 
413 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  51.63 
 
 
414 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  47.58 
 
 
417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  52.74 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  45.45 
 
 
411 aa  318  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  44.12 
 
 
416 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  46.53 
 
 
415 aa  313  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  44.41 
 
 
411 aa  308  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  45.53 
 
 
411 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  43.03 
 
 
407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  46.7 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  39.76 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  43.29 
 
 
413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  42.27 
 
 
443 aa  279  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  42.47 
 
 
391 aa  278  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  42.86 
 
 
428 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  40.2 
 
 
406 aa  270  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  42.04 
 
 
393 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  40.94 
 
 
425 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  37.23 
 
 
412 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  36.74 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  33.65 
 
 
420 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  33.7 
 
 
440 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  35.99 
 
 
486 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  33.81 
 
 
433 aa  199  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  35.82 
 
 
426 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  34.88 
 
 
419 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  34.03 
 
 
421 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  33.84 
 
 
456 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  32.27 
 
 
478 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  31.4 
 
 
451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  33.01 
 
 
445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  35.36 
 
 
447 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  31.57 
 
 
407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  32.43 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  32.99 
 
 
445 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  34.85 
 
 
461 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  32.98 
 
 
407 aa  179  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  30.05 
 
 
429 aa  179  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  28.77 
 
 
436 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  32.18 
 
 
430 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  32.78 
 
 
482 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  32.29 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  34.05 
 
 
426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  32.81 
 
 
428 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  29.89 
 
 
490 aa  170  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  34.15 
 
 
438 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  33.17 
 
 
433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.18 
 
 
447 aa  166  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  34.29 
 
 
440 aa  166  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  33.86 
 
 
434 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.05 
 
 
407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  35.18 
 
 
408 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  34.19 
 
 
444 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  34.75 
 
 
391 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  33.49 
 
 
433 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  30.4 
 
 
437 aa  156  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  32.53 
 
 
444 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  29.78 
 
 
431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  33.96 
 
 
470 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  29.57 
 
 
401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.71 
 
 
434 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  33.16 
 
 
433 aa  150  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  30.46 
 
 
447 aa  150  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  30.58 
 
 
396 aa  149  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  32.36 
 
 
432 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  28.22 
 
 
431 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  32.11 
 
 
459 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  33.24 
 
 
426 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  30.17 
 
 
400 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  30.36 
 
 
444 aa  146  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  30.6 
 
 
405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  27.83 
 
 
459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  35.09 
 
 
415 aa  146  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  28.4 
 
 
441 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  32.05 
 
 
423 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  30.43 
 
 
422 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  32.98 
 
 
409 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  30.02 
 
 
407 aa  143  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.09 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  30.64 
 
 
455 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  35.05 
 
 
422 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  31.16 
 
 
411 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  33.81 
 
 
429 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  31.19 
 
 
417 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>