More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0258 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  100 
 
 		 441 aa  910    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  46.24 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  42.86 
 
 		 456 aa  345  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  38.82 
 
 		 480 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  29.02 
 
 		 568 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  28.32 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  28.05 
 
 		 438 aa  119  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  27.97 
 
 		 426 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  29.63 
 
 		 1084 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  28.25 
 
 		 819 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  25.05 
 
 		 585 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.91 
 
 		 430 aa  113  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  27.31 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  26.28 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  26.61 
 
 		 407 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  25.49 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  24.46 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.41 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  26.8 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  25.98 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  25.79 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  27.89 
 
 		 1062 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  26.86 
 
 		 666 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  25 
 
 		 426 aa  99.8  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  25.96 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  25.76 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  25.96 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  25.8 
 
 		 470 aa  97.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  26.9 
 
 		 433 aa  97.1  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  27.67 
 
 		 448 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  25.56 
 
 		 401 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  26.41 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  24.24 
 
 		 540 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  28.47 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  24.77 
 
 		 447 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  24.89 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  24.12 
 
 		 692 aa  90.5  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  24.66 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.46 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.43 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  24.71 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  24.94 
 
 		 381 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  24.7 
 
 		 443 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  23.53 
 
 		 1005 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  25.17 
 
 		 433 aa  87  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  24.68 
 
 		 490 aa  86.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  25.22 
 
 		 680 aa  86.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  26.79 
 
 		 428 aa  86.3  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  24.01 
 
 		 686 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  25.51 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  25.39 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  25.78 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  24.44 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  25.87 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  25.55 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  25.99 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  23.8 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  25.39 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  25.45 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  24.88 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  25.66 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  25.66 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  25.66 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  23.37 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  23.99 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  23.63 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  24.4 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  22.87 
 
 		 672 aa  80.9  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  25.65 
 
 		 1065 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  25.35 
 
 		 1066 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  24.16 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  25.32 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  22.3 
 
 		 410 aa  79.7  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  24.26 
 
 		 1062 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  25.3 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  24.12 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  28.93 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  23.96 
 
 		 1060 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  27.12 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  26.8 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  25.27 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  28.57 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  24.28 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  24.74 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  25.05 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  23.58 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  26.17 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  30.08 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0846  amidohydrolase  22.66 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  24.32 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  24.77 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  25.19 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  24.61 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  26.22 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  25.99 
 
 		 1078 aa  73.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  24.31 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  24.95 
 
 		 702 aa  73.6  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  22.4 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.04 
 
 		 1081 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>