210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3381 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  66.96 
 
 		 451 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  100 
 
 		 455 aa  942    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  41.88 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  31.31 
 
 		 478 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  29.98 
 
 		 490 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  29.4 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  27.71 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  27.29 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  25.62 
 
 		 512 aa  136  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  27.04 
 
 		 496 aa  136  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  26.9 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  25.12 
 
 		 686 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  24.83 
 
 		 400 aa  109  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  25.37 
 
 		 666 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  25.43 
 
 		 484 aa  99.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  25.85 
 
 		 702 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  22.63 
 
 		 438 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  22.48 
 
 		 672 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  24.71 
 
 		 680 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  23.82 
 
 		 694 aa  93.6  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  24.69 
 
 		 1059 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  25.73 
 
 		 1062 aa  89.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  24.48 
 
 		 407 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  23.68 
 
 		 432 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  25.12 
 
 		 692 aa  87.4  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  25.75 
 
 		 444 aa  86.7  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  24.38 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  26.44 
 
 		 1010 aa  84  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  24.43 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  23.77 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  22.76 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  23.31 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  24.7 
 
 		 1138 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  25.64 
 
 		 1005 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  22.88 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.41 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  26.02 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  23.91 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  24.63 
 
 		 1031 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  24.06 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  43.48 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  24.02 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  23.94 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  22.79 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  24.08 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  25.53 
 
 		 1042 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  36.07 
 
 		 1062 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  23.89 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  23.97 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  25.33 
 
 		 1040 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  36.07 
 
 		 1062 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  24.14 
 
 		 543 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  25.22 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  21.95 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  36.07 
 
 		 1062 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  22.62 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1042 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  22.66 
 
 		 529 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  24.22 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  36.07 
 
 		 1062 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  21.48 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  36.73 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  23.25 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  24.07 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  20.92 
 
 		 1113 aa  66.6  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  39.13 
 
 		 568 aa  66.6  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  23.49 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  23.02 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  35.25 
 
 		 598 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  23.57 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  21.97 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  24.18 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  30.84 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  20.08 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  22.2 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  23.23 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  23.69 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  22.54 
 
 		 819 aa  64.3  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  23.85 
 
 		 585 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  28.35 
 
 		 1052 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  34.43 
 
 		 1066 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  32.31 
 
 		 1071 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  21.37 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  34.43 
 
 		 1069 aa  60.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  35.04 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  31.97 
 
 		 1060 aa  60.1  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  22.76 
 
 		 1014 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  35.25 
 
 		 1081 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  19.79 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  25.77 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  36.07 
 
 		 1067 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  32.46 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  21.53 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  33.64 
 
 		 1078 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  33.61 
 
 		 1062 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  34.83 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  31.3 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  32.79 
 
 		 1062 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  30.11 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.76 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>