More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3965 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  100 
 
 		 411 aa  833    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  95.13 
 
 		 411 aa  797    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  62.28 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  58.27 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  52.33 
 
 		 411 aa  411  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  52.48 
 
 		 412 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  50 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  46.68 
 
 		 411 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  48.29 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  48.29 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  50.78 
 
 		 413 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  49.87 
 
 		 413 aa  358  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  49.61 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  50 
 
 		 413 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  49.48 
 
 		 436 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  46.9 
 
 		 415 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  48.18 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  47.46 
 
 		 425 aa  342  5e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  50.72 
 
 		 405 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  46.8 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  42.61 
 
 		 408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  42.36 
 
 		 443 aa  292  6e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  44.57 
 
 		 418 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  41.59 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  44.12 
 
 		 409 aa  285  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  46.7 
 
 		 403 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  42.17 
 
 		 413 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  43 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  39.28 
 
 		 445 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  40.39 
 
 		 407 aa  262  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  38.46 
 
 		 406 aa  262  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  36.5 
 
 		 412 aa  258  9e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  36.21 
 
 		 412 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  40.34 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  35.41 
 
 		 419 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  36.06 
 
 		 428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  34.53 
 
 		 451 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  33.57 
 
 		 420 aa  223  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  33.73 
 
 		 436 aa  219  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  34.82 
 
 		 456 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  34.29 
 
 		 461 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  37.25 
 
 		 393 aa  216  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  34.93 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  33.73 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  33.82 
 
 		 486 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  35.55 
 
 		 429 aa  206  8e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  32.86 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  35.15 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  35.15 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  34.28 
 
 		 426 aa  203  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  34.47 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  31.9 
 
 		 478 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  33.33 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  34.39 
 
 		 440 aa  193  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  33.81 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  33.64 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.7 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  34.04 
 
 		 490 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  34.35 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  33.41 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  31.87 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  32.69 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  30.66 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  32.2 
 
 		 421 aa  169  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.58 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  29.88 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  33.65 
 
 		 426 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  32.44 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.71 
 
 		 413 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  33.81 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  33.81 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  31.57 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  33.81 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  31.93 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  33.08 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  32.71 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  32.68 
 
 		 438 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  32.83 
 
 		 407 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  31.58 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  30.92 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  30.19 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  30.22 
 
 		 430 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  30.92 
 
 		 426 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.95 
 
 		 444 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  31.59 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  32.58 
 
 		 444 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  31.55 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  28.84 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  31.63 
 
 		 432 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  33.24 
 
 		 428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  29.27 
 
 		 470 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  31.03 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  31.71 
 
 		 408 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  29.56 
 
 		 407 aa  143  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  31.71 
 
 		 408 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  31.71 
 
 		 408 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  30.34 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  34.15 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  29.38 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  31.55 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>