More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2089 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  100 
 
 		 416 aa  833    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  64.55 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  59.31 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  60.05 
 
 		 436 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  58.58 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  58.09 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  58.09 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  57.78 
 
 		 412 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  55.58 
 
 		 411 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  54.24 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  53.75 
 
 		 419 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  60.32 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  54.03 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  52.06 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  49.75 
 
 		 411 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  50 
 
 		 411 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  48.19 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  49.17 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  46.45 
 
 		 405 aa  345  7e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  47.34 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  48.92 
 
 		 407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  47.1 
 
 		 425 aa  335  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  43.83 
 
 		 413 aa  328  8e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  41.3 
 
 		 408 aa  326  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  48.05 
 
 		 461 aa  325  8.000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  46.08 
 
 		 391 aa  323  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  43.81 
 
 		 406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  44.12 
 
 		 403 aa  315  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  40.29 
 
 		 412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  40.05 
 
 		 412 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  45.45 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  40.98 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  43.34 
 
 		 409 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  41.3 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  41.95 
 
 		 443 aa  282  9e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  43.08 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  36.74 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  35.14 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  39.02 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  38.42 
 
 		 482 aa  242  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  35.66 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  38.85 
 
 		 486 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  36.67 
 
 		 461 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  37.26 
 
 		 429 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  34.76 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  36.24 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  35.06 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  39.57 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  35.06 
 
 		 430 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  36.56 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  33.8 
 
 		 440 aa  219  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  33.02 
 
 		 445 aa  219  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  35.6 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  32.61 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  35 
 
 		 426 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  36.14 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  35.01 
 
 		 430 aa  210  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.56 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  31.74 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  35.37 
 
 		 405 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  34.12 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  32.23 
 
 		 445 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  32.23 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  32.56 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  35.79 
 
 		 421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.86 
 
 		 451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  35.56 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  31.28 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  35.56 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  35.56 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  34.13 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  34.58 
 
 		 431 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  31.13 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  36.13 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  34.52 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  32.7 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  33.56 
 
 		 470 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  33.49 
 
 		 433 aa  193  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  32.81 
 
 		 447 aa  192  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  36.87 
 
 		 440 aa  189  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  30.64 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.77 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  35.27 
 
 		 459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  32.28 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  36.39 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  34.82 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  34.59 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  34.59 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  32.46 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  32.37 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  32.91 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  31.98 
 
 		 434 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  33.6 
 
 		 428 aa  176  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.5 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  32.77 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  32.86 
 
 		 404 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  32.28 
 
 		 426 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  36.22 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  36.36 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  30.7 
 
 		 400 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>