270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0545 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  100 
 
 
415 aa  839    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  64.55 
 
 
416 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  56.68 
 
 
420 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  55.69 
 
 
413 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  57.39 
 
 
436 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  55.69 
 
 
413 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  56.68 
 
 
413 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  55.75 
 
 
419 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  55.26 
 
 
419 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  53.87 
 
 
411 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  57.79 
 
 
412 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  57.18 
 
 
405 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  50.99 
 
 
414 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  49.64 
 
 
413 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  48.43 
 
 
417 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  46.9 
 
 
411 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  46.15 
 
 
411 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  47.39 
 
 
411 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  47.8 
 
 
407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  49.32 
 
 
425 aa  315  7e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  46.53 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  48.56 
 
 
461 aa  309  5e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  44.12 
 
 
425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  44.42 
 
 
406 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  42.14 
 
 
413 aa  306  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  43.56 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  43.33 
 
 
391 aa  299  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  42.18 
 
 
408 aa  292  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  47.24 
 
 
418 aa  288  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  42.57 
 
 
409 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  37.41 
 
 
412 aa  276  4e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  36.87 
 
 
412 aa  276  7e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  45.43 
 
 
393 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  43.29 
 
 
428 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  44.2 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  42.82 
 
 
445 aa  261  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  35.95 
 
 
461 aa  229  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  34.36 
 
 
436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  34.12 
 
 
420 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  37.66 
 
 
486 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  34.12 
 
 
433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  34.28 
 
 
456 aa  213  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  36.77 
 
 
490 aa  211  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  34.32 
 
 
426 aa  210  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  34.44 
 
 
419 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  34.83 
 
 
429 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  34.2 
 
 
451 aa  206  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  34.91 
 
 
478 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  37.2 
 
 
447 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  33.79 
 
 
434 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  33.02 
 
 
440 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  35.75 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  32.94 
 
 
445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  33.73 
 
 
482 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  32.3 
 
 
445 aa  193  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  34.54 
 
 
438 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  34.59 
 
 
444 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  34.77 
 
 
421 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  34.12 
 
 
433 aa  189  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.86 
 
 
447 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.62 
 
 
407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  35.1 
 
 
405 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  30.84 
 
 
426 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  34.34 
 
 
470 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  29.29 
 
 
459 aa  179  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  34.75 
 
 
430 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  31.99 
 
 
413 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  31.78 
 
 
437 aa  176  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  34 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  35.24 
 
 
459 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  31.37 
 
 
407 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  34.15 
 
 
430 aa  170  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.6 
 
 
426 aa  168  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  35.26 
 
 
444 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  32.18 
 
 
428 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  27.63 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  33.59 
 
 
440 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  35.03 
 
 
433 aa  167  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  29.7 
 
 
447 aa  166  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  33.02 
 
 
433 aa  166  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.23 
 
 
431 aa  166  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.42 
 
 
434 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  31.31 
 
 
400 aa  163  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  34.08 
 
 
408 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  34.08 
 
 
408 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  34.08 
 
 
408 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  32.4 
 
 
441 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  32.52 
 
 
423 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  32.79 
 
 
431 aa  159  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  32.55 
 
 
412 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  32.32 
 
 
411 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  33.33 
 
 
422 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  34.52 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  33.33 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  31.93 
 
 
409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  33.33 
 
 
421 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  31.57 
 
 
407 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  33.42 
 
 
426 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  28.68 
 
 
401 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  34.89 
 
 
408 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>