269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0436 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  100 
 
 
417 aa  824    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  51.46 
 
 
419 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  49.88 
 
 
420 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  50.97 
 
 
419 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  49.88 
 
 
436 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  48.2 
 
 
413 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  48.57 
 
 
413 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  48.57 
 
 
413 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  49.88 
 
 
412 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  49.17 
 
 
416 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  48.43 
 
 
415 aa  363  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  49.47 
 
 
405 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  45.1 
 
 
411 aa  342  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  46.17 
 
 
413 aa  343  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  47.61 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  47.69 
 
 
414 aa  332  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  47.58 
 
 
403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  46.82 
 
 
391 aa  323  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  47.1 
 
 
407 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  43.37 
 
 
408 aa  319  7e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  43.86 
 
 
411 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  46.57 
 
 
413 aa  316  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  45.95 
 
 
461 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  47.95 
 
 
425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  45.59 
 
 
418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  46.27 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  43.8 
 
 
405 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  41.43 
 
 
412 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  42.41 
 
 
406 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  41.19 
 
 
412 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  42.75 
 
 
409 aa  290  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  47.81 
 
 
393 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  41.59 
 
 
411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  41.83 
 
 
411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  41.97 
 
 
443 aa  283  5.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  36.92 
 
 
445 aa  276  6e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  41.2 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  40.6 
 
 
486 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  39.76 
 
 
461 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  37.7 
 
 
490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  37.09 
 
 
456 aa  232  9e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  35.55 
 
 
478 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  37.41 
 
 
482 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  34.49 
 
 
440 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  37.68 
 
 
436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  38.46 
 
 
438 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  34.88 
 
 
433 aa  221  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  35.93 
 
 
426 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  37.59 
 
 
434 aa  219  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  36.34 
 
 
426 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  36.83 
 
 
445 aa  216  8e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  37.28 
 
 
429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  34.64 
 
 
451 aa  213  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  36.03 
 
 
428 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  34.58 
 
 
420 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  34.31 
 
 
430 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  36.49 
 
 
407 aa  206  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  33.41 
 
 
447 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  32.85 
 
 
426 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  34.2 
 
 
419 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  35.52 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  35.93 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  35.25 
 
 
432 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  36.04 
 
 
459 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  31.53 
 
 
444 aa  192  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  35.11 
 
 
421 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  33.25 
 
 
445 aa  189  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  33.42 
 
 
441 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  35.01 
 
 
444 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  34.66 
 
 
411 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  32.85 
 
 
405 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  34.99 
 
 
408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  34.99 
 
 
408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  34.99 
 
 
408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  38.78 
 
 
422 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  32.43 
 
 
413 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  29.86 
 
 
459 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  33.17 
 
 
440 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.17 
 
 
407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  35.15 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  31.09 
 
 
431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  36.14 
 
 
421 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  31.37 
 
 
422 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  35.13 
 
 
409 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  32.24 
 
 
444 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  35.44 
 
 
424 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  35.03 
 
 
402 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  34.89 
 
 
409 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  34.63 
 
 
417 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  34.89 
 
 
409 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  34.63 
 
 
417 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  34.63 
 
 
417 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  31.13 
 
 
426 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  30.34 
 
 
426 aa  166  8e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  35.45 
 
 
429 aa  166  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  31.3 
 
 
401 aa  166  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.14 
 
 
431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  33.17 
 
 
421 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  30.67 
 
 
407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  32.7 
 
 
428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>