More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4994 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  100 
 
 
413 aa  833    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  92.74 
 
 
420 aa  780    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  80.44 
 
 
436 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  92.49 
 
 
413 aa  770    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  95.68 
 
 
405 aa  720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  92.74 
 
 
413 aa  774    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  76.06 
 
 
412 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  67.73 
 
 
419 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  67.48 
 
 
419 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  58.58 
 
 
416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  56.02 
 
 
411 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  56.68 
 
 
415 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  53.58 
 
 
414 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  52.84 
 
 
413 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  50.12 
 
 
425 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  48.2 
 
 
417 aa  378  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  50.78 
 
 
411 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  48.18 
 
 
411 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  48.05 
 
 
411 aa  362  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  52.09 
 
 
403 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  46.44 
 
 
405 aa  351  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  51.48 
 
 
418 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  44.74 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  50.12 
 
 
461 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  46.36 
 
 
409 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  45.07 
 
 
407 aa  317  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  43.2 
 
 
413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  41.12 
 
 
445 aa  298  1e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  43.1 
 
 
428 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  43.7 
 
 
391 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  44.67 
 
 
425 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  42.16 
 
 
406 aa  286  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  42.89 
 
 
443 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  36.78 
 
 
412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  36.96 
 
 
412 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  44.84 
 
 
393 aa  273  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  37.71 
 
 
486 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  36.25 
 
 
433 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  33.97 
 
 
436 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  36.78 
 
 
461 aa  230  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  35.17 
 
 
456 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  34.27 
 
 
445 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  37.5 
 
 
478 aa  226  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  36.34 
 
 
490 aa  222  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  36.65 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  35.71 
 
 
419 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  36.07 
 
 
420 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  33.49 
 
 
440 aa  216  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  38.01 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  37.47 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  35.17 
 
 
434 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  33.73 
 
 
426 aa  212  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  34.16 
 
 
429 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  33.18 
 
 
445 aa  209  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  33.67 
 
 
459 aa  206  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.29 
 
 
451 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.96 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  32.29 
 
 
430 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  33.17 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.86 
 
 
413 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  35.19 
 
 
438 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.89 
 
 
447 aa  193  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  31.75 
 
 
407 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  31.03 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  32.14 
 
 
412 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  32.64 
 
 
411 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.38 
 
 
431 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  32.86 
 
 
408 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.86 
 
 
408 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  32.86 
 
 
408 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  30.32 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  33.73 
 
 
459 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.92 
 
 
428 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  30.1 
 
 
431 aa  179  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.19 
 
 
441 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  34.27 
 
 
433 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  32.93 
 
 
423 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  31.46 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  32.3 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.21 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  33.25 
 
 
440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.34 
 
 
426 aa  172  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  31.46 
 
 
405 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  31.42 
 
 
409 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  32.54 
 
 
426 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  34.27 
 
 
432 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  32.59 
 
 
437 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  33.5 
 
 
417 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  33.5 
 
 
417 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  33.5 
 
 
417 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  31.71 
 
 
407 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  35.44 
 
 
408 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  33.5 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  28.68 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  31.78 
 
 
424 aa  166  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.3 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  32.03 
 
 
421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  34.57 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  34.86 
 
 
409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  34.84 
 
 
409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>