278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2437 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  100 
 
 
411 aa  824    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  90.15 
 
 
408 aa  729    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  90.15 
 
 
408 aa  729    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  92.86 
 
 
412 aa  762    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  90.15 
 
 
408 aa  729    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  71.46 
 
 
402 aa  566  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  66.34 
 
 
403 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  66.17 
 
 
404 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  59.1 
 
 
402 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  60.73 
 
 
419 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  57.74 
 
 
414 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  58.98 
 
 
424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  59.02 
 
 
417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  57.7 
 
 
429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  59.02 
 
 
417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  59.02 
 
 
417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  58.98 
 
 
421 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  40.15 
 
 
430 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  41.59 
 
 
405 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  39.56 
 
 
426 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  40.66 
 
 
440 aa  259  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  39.62 
 
 
441 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  37.62 
 
 
431 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  39.17 
 
 
431 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  39.81 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  39.7 
 
 
426 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  41.62 
 
 
430 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  38.86 
 
 
445 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  39.81 
 
 
444 aa  246  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  37.47 
 
 
426 aa  243  6e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  39.53 
 
 
444 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  38.81 
 
 
433 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  39.18 
 
 
438 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  40.11 
 
 
455 aa  230  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  40.58 
 
 
433 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  39.75 
 
 
407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  37.37 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  36.7 
 
 
437 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  39.14 
 
 
444 aa  219  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  36.54 
 
 
421 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  36.39 
 
 
459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  36.84 
 
 
433 aa  213  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  34.72 
 
 
407 aa  203  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  35.06 
 
 
419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  33.91 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  36.55 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  34.67 
 
 
407 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  34.7 
 
 
422 aa  199  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  35.06 
 
 
419 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  34.15 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  36.17 
 
 
480 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  36.43 
 
 
423 aa  196  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  36.13 
 
 
416 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  34.23 
 
 
401 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  33.97 
 
 
431 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  33.79 
 
 
420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  34.22 
 
 
426 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  34.66 
 
 
417 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  33.96 
 
 
425 aa  187  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.49 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  33.02 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  35.28 
 
 
423 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  33.56 
 
 
413 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.56 
 
 
413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  32.64 
 
 
413 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  36.27 
 
 
391 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  34.43 
 
 
436 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  32.71 
 
 
470 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  31.5 
 
 
400 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.69 
 
 
413 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  34.9 
 
 
396 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  33.58 
 
 
409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  31.49 
 
 
409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  32.71 
 
 
412 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  32.3 
 
 
418 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  34.92 
 
 
432 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  35.41 
 
 
426 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  31.59 
 
 
445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  31.94 
 
 
415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  31.87 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  32.56 
 
 
410 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  36.25 
 
 
409 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  36.25 
 
 
409 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  33.17 
 
 
405 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  36.25 
 
 
409 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  32.52 
 
 
390 aa  162  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  32.92 
 
 
413 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  34.84 
 
 
425 aa  159  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  32.1 
 
 
478 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  33.76 
 
 
423 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  31.53 
 
 
408 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  32.39 
 
 
461 aa  157  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  33.76 
 
 
423 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  32.59 
 
 
407 aa  156  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  31.53 
 
 
428 aa  155  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  33.09 
 
 
411 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  32.32 
 
 
415 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  34.93 
 
 
414 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  32.01 
 
 
461 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  34.63 
 
 
406 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>