238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0060 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  100 
 
 		 440 aa  917    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  41.65 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  41.3 
 
 		 447 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  41.11 
 
 		 461 aa  296  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  39.35 
 
 		 486 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  39.08 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  39.17 
 
 		 445 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  37.3 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  37.12 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  38.32 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  35.73 
 
 		 478 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  35.12 
 
 		 482 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  38.23 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  36.78 
 
 		 426 aa  252  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  37.71 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  37.38 
 
 		 420 aa  250  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  33.68 
 
 		 490 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  35.85 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  35.08 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  35.2 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  35.33 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  36.79 
 
 		 412 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  37.41 
 
 		 412 aa  236  8e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  35.08 
 
 		 414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  34.69 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  35.61 
 
 		 413 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  35.02 
 
 		 419 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  34.97 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  36.34 
 
 		 459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  34.04 
 
 		 411 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  36.49 
 
 		 425 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  34.49 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  33.17 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  35.08 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  33.8 
 
 		 416 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  33.65 
 
 		 413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  33.49 
 
 		 413 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  34.22 
 
 		 412 aa  216  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.65 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.71 
 
 		 447 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  34.74 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  34.64 
 
 		 420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  32.53 
 
 		 418 aa  212  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  34.74 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  33.18 
 
 		 408 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  34.93 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  34.8 
 
 		 391 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  33.64 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  33.7 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  32.77 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  32 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  32.06 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  33.02 
 
 		 415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  33.69 
 
 		 461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  35.66 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  32.45 
 
 		 409 aa  193  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  34.5 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  29.38 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  30.05 
 
 		 445 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.75 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  29.17 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  28.44 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  27.56 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  27.85 
 
 		 407 aa  149  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  28.71 
 
 		 407 aa  146  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  28.18 
 
 		 400 aa  146  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  27.59 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  26.81 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  27.25 
 
 		 430 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  28.41 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  29.23 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  27.23 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  29.29 
 
 		 423 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.47 
 
 		 438 aa  136  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.28 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  27.38 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.1 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  27.74 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  26.62 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  25.34 
 
 		 422 aa  126  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  28.42 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  27.9 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  28.33 
 
 		 390 aa  123  8e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  27.43 
 
 		 434 aa  122  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.7 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  28.47 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  28.47 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  28.47 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  27.47 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  28.03 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  28.26 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.89 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  28.68 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  27.64 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  27.64 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  27.64 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  28.48 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  27.75 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  25.72 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  27.75 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>