More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0420 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  100 
 
 
418 aa  831    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  59.31 
 
 
403 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  53.01 
 
 
425 aa  405  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  58.29 
 
 
461 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  51.85 
 
 
409 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  49.03 
 
 
436 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  51.48 
 
 
413 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  46.08 
 
 
405 aa  344  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  51.9 
 
 
420 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  49.15 
 
 
412 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  51.23 
 
 
413 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  51.23 
 
 
413 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  44.53 
 
 
408 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  46.39 
 
 
419 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  47.65 
 
 
414 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  46.27 
 
 
419 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  47.03 
 
 
413 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  45.59 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  45.45 
 
 
416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  48.18 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  51.22 
 
 
405 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  43.14 
 
 
411 aa  300  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  45.68 
 
 
411 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  42.62 
 
 
443 aa  293  3e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  47.24 
 
 
415 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  44.57 
 
 
411 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  38.48 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  43.72 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  40.94 
 
 
411 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  41.15 
 
 
406 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  44.14 
 
 
413 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  44.53 
 
 
428 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  47.54 
 
 
393 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  43.08 
 
 
425 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  37.25 
 
 
412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  36.52 
 
 
412 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  35.93 
 
 
461 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  37.62 
 
 
447 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  35.7 
 
 
486 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  32.53 
 
 
440 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  34.92 
 
 
478 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  36.21 
 
 
434 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  33.73 
 
 
456 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  34.92 
 
 
433 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.92 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  31.18 
 
 
436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  34.96 
 
 
490 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  34.37 
 
 
482 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  33.17 
 
 
420 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.59 
 
 
413 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  34.58 
 
 
421 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  33.42 
 
 
419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  32.38 
 
 
426 aa  182  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  35.06 
 
 
407 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  31.42 
 
 
445 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  32.98 
 
 
407 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  29.62 
 
 
429 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  31.13 
 
 
437 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  31.76 
 
 
426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  35.77 
 
 
438 aa  179  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  32.54 
 
 
433 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.5 
 
 
434 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  33.24 
 
 
447 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  38.27 
 
 
432 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  32.01 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  32.01 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  32.35 
 
 
430 aa  173  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  29.72 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  32.08 
 
 
426 aa  172  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.66 
 
 
447 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  32.3 
 
 
411 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  37.7 
 
 
408 aa  170  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  33.15 
 
 
405 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  30.95 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.53 
 
 
431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  31.31 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.49 
 
 
430 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  34.28 
 
 
433 aa  162  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  32.4 
 
 
408 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.4 
 
 
408 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  32.4 
 
 
408 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  28.4 
 
 
431 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  30.9 
 
 
407 aa  160  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  34.04 
 
 
440 aa  160  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  31.44 
 
 
445 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  36.72 
 
 
459 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  34.46 
 
 
391 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.62 
 
 
441 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  33.09 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  32.02 
 
 
423 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  31.94 
 
 
400 aa  154  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  31.03 
 
 
470 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  33.51 
 
 
414 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  30.62 
 
 
401 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  33.77 
 
 
415 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  31.25 
 
 
444 aa  149  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  34.81 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  32.14 
 
 
423 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  30.33 
 
 
429 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  28.84 
 
 
459 aa  142  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>