More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06184 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  100 
 
 
420 aa  871    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  80.24 
 
 
419 aa  714    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  42.39 
 
 
433 aa  303  5.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  42.19 
 
 
445 aa  298  9e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  40.76 
 
 
486 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  40.19 
 
 
436 aa  296  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  40.43 
 
 
461 aa  288  9e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  38.86 
 
 
429 aa  278  9e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  36.05 
 
 
490 aa  276  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  40.14 
 
 
426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  38.69 
 
 
447 aa  273  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  39.16 
 
 
434 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  37.12 
 
 
482 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  36.68 
 
 
447 aa  269  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  40 
 
 
444 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  36.26 
 
 
447 aa  266  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  36.92 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  37.38 
 
 
440 aa  250  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  35.66 
 
 
416 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  35.98 
 
 
478 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  36.19 
 
 
451 aa  236  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  34.83 
 
 
408 aa  235  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  36.08 
 
 
425 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  34.66 
 
 
414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  36.92 
 
 
419 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  37.15 
 
 
419 aa  232  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  34.93 
 
 
459 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  33.65 
 
 
405 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  35.07 
 
 
412 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  33.57 
 
 
411 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  37.65 
 
 
407 aa  220  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  36.07 
 
 
413 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  35.85 
 
 
413 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  35.31 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  33.57 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  33.25 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  35.61 
 
 
413 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  34.12 
 
 
415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  38.06 
 
 
436 aa  216  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  34.03 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  34.12 
 
 
406 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  33.65 
 
 
403 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  34.19 
 
 
411 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  34.58 
 
 
417 aa  210  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  33.56 
 
 
412 aa  209  9e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  33.56 
 
 
412 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  32.48 
 
 
445 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  33.41 
 
 
425 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  32.3 
 
 
428 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.72 
 
 
430 aa  196  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  33.18 
 
 
461 aa  192  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  33.17 
 
 
418 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  34.72 
 
 
405 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  32.4 
 
 
426 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  33.25 
 
 
409 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  31.7 
 
 
413 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  32.01 
 
 
391 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  32.94 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.51 
 
 
431 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  30.79 
 
 
440 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.83 
 
 
423 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  31.03 
 
 
426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.33 
 
 
426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  29.91 
 
 
407 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  30.3 
 
 
445 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.09 
 
 
413 aa  163  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  29.23 
 
 
455 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  29.93 
 
 
407 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  30.12 
 
 
431 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  31.68 
 
 
441 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  30.24 
 
 
430 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  29.98 
 
 
405 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  30.17 
 
 
407 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  30.18 
 
 
421 aa  147  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  31.65 
 
 
433 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.64 
 
 
444 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  28.16 
 
 
437 aa  142  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.36 
 
 
426 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  29.95 
 
 
438 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  31.12 
 
 
432 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  27.38 
 
 
409 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  30.9 
 
 
408 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  30.12 
 
 
444 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  27.77 
 
 
470 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  28.31 
 
 
400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  28.6 
 
 
421 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  29.37 
 
 
409 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  29.37 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  29.37 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  29.87 
 
 
407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  28.81 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  29.1 
 
 
433 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  29.26 
 
 
391 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  28.5 
 
 
459 aa  126  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  29.74 
 
 
417 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  29.74 
 
 
417 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  29.74 
 
 
417 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  29.06 
 
 
412 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  26.99 
 
 
415 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>