More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1062 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  100 
 
 		 426 aa  865    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  58.82 
 
 		 426 aa  501  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  58.31 
 
 		 455 aa  478  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  56.65 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  57.18 
 
 		 423 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  58.97 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  55.61 
 
 		 431 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  45.09 
 
 		 438 aa  354  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  46.45 
 
 		 445 aa  332  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  43.18 
 
 		 433 aa  322  7e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  42.51 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  42.13 
 
 		 444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  43.61 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  43.06 
 
 		 432 aa  312  9e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  42.05 
 
 		 407 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  39.61 
 
 		 459 aa  302  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  43.68 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  39.35 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  41.07 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  42.03 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  40.28 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  39.08 
 
 		 431 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  41.4 
 
 		 430 aa  266  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  38.15 
 
 		 422 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  39.66 
 
 		 419 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  40.35 
 
 		 405 aa  257  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  39.57 
 
 		 412 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  38.46 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  41.34 
 
 		 402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  39.7 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  39.95 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  39.95 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  39.95 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  37.08 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  38.19 
 
 		 421 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  37.56 
 
 		 429 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  37.17 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  36.17 
 
 		 470 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  38.2 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  38.19 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  38.19 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  38.19 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  36.82 
 
 		 424 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  38.43 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  37.66 
 
 		 402 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  37.3 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  37.7 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  37.6 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  35.08 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  34.7 
 
 		 413 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  35.63 
 
 		 407 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  36.63 
 
 		 423 aa  223  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  32.61 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  33.25 
 
 		 420 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  33.73 
 
 		 413 aa  212  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  36.09 
 
 		 421 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  36.51 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  32.77 
 
 		 409 aa  210  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  32.94 
 
 		 425 aa  209  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  37.12 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.33 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  33.33 
 
 		 413 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  36.89 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  33.01 
 
 		 417 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  32.37 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  32.13 
 
 		 419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.62 
 
 		 411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  31.39 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  36.55 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  33.09 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  34.23 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  32.69 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  33.86 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  31.33 
 
 		 443 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  32.34 
 
 		 478 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  32.29 
 
 		 436 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  34.96 
 
 		 410 aa  189  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  32.52 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  30.99 
 
 		 405 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  32.4 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  32.44 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  32.2 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.35 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  30.94 
 
 		 412 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  33.11 
 
 		 434 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  32.6 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  30.94 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  32.87 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  31.29 
 
 		 419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  32.92 
 
 		 409 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  32.92 
 
 		 409 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  31.76 
 
 		 418 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  32.92 
 
 		 409 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  30.84 
 
 		 415 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  31.14 
 
 		 413 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  32.43 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  32.06 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  34.86 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  31.16 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  31.46 
 
 		 407 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>