More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0533 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  100 
 
 		 444 aa  899    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  54.41 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  54.41 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  51.79 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  53.4 
 
 		 405 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  51.08 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  49.29 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  46.41 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  48.16 
 
 		 444 aa  340  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  47.1 
 
 		 422 aa  334  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  45.95 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  39.34 
 
 		 440 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  41.65 
 
 		 438 aa  266  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  41.73 
 
 		 414 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  41.73 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  37.47 
 
 		 426 aa  257  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  39.59 
 
 		 459 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  41.05 
 
 		 432 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  41.87 
 
 		 419 aa  255  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  38.57 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  38.46 
 
 		 426 aa  254  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  40.28 
 
 		 429 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  40.54 
 
 		 455 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  41.79 
 
 		 424 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  38.54 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  37.3 
 
 		 407 aa  249  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  39.81 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  36.08 
 
 		 428 aa  246  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  39.81 
 
 		 411 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  40.93 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  39.06 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  39.06 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  39.06 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  40.58 
 
 		 421 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  38.77 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  39.25 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  38.5 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  36.02 
 
 		 421 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  38.28 
 
 		 408 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  40.38 
 
 		 402 aa  237  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  38.28 
 
 		 408 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  38.28 
 
 		 408 aa  237  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  36.84 
 
 		 470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  37.04 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  38.42 
 
 		 423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  36.79 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  36.59 
 
 		 437 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  35.89 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  38.73 
 
 		 423 aa  223  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  35.41 
 
 		 409 aa  223  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  37.41 
 
 		 407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  35.32 
 
 		 404 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  35.2 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  34.29 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  35.22 
 
 		 480 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  34.13 
 
 		 416 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  34.25 
 
 		 421 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  35.28 
 
 		 425 aa  197  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  34.97 
 
 		 413 aa  196  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  34.45 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  35.48 
 
 		 432 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  34.78 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  32.61 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  35.01 
 
 		 417 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  32.61 
 
 		 419 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  33.58 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  33.58 
 
 		 411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  33.26 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  33.1 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  34.46 
 
 		 391 aa  179  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  32.43 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  31.23 
 
 		 420 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  32.7 
 
 		 407 aa  176  9e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  31.46 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  31.31 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  31.31 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  33.42 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  33.64 
 
 		 486 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  34.5 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  29.62 
 
 		 412 aa  170  5e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  33.41 
 
 		 461 aa  169  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  35.26 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  29.74 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  32.52 
 
 		 408 aa  167  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  34.93 
 
 		 413 aa  166  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  32.05 
 
 		 415 aa  166  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  28.93 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  32.23 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  31.76 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  32.23 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  30.97 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  30.94 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  31.38 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  34.19 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  30.72 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  31.18 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  31.17 
 
 		 413 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  30.87 
 
 		 446 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  32.49 
 
 		 411 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>