288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4622 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  95.68 
 
 
420 aa  721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  95.68 
 
 
413 aa  720    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  84.05 
 
 
436 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  99.46 
 
 
413 aa  744    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  100 
 
 
405 aa  824    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  100 
 
 
413 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  77.05 
 
 
412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  69.62 
 
 
419 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  69.62 
 
 
419 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  60.32 
 
 
416 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  57.61 
 
 
411 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  57.18 
 
 
415 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  54.35 
 
 
414 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  54.99 
 
 
413 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  49.47 
 
 
417 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  50.53 
 
 
425 aa  336  5e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  48.92 
 
 
405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  52.74 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  48.78 
 
 
411 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  48.1 
 
 
411 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  50.72 
 
 
411 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  50.53 
 
 
461 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  44.32 
 
 
408 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  51.22 
 
 
418 aa  300  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  48.53 
 
 
409 aa  300  4e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  45.53 
 
 
407 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  43.01 
 
 
445 aa  283  5.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  42.71 
 
 
428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  43.7 
 
 
413 aa  269  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  45.63 
 
 
425 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  45.14 
 
 
391 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  42.86 
 
 
406 aa  260  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  45.23 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  42.74 
 
 
443 aa  253  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  38.2 
 
 
412 aa  252  7e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  37.73 
 
 
412 aa  252  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  37.5 
 
 
486 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  35.06 
 
 
445 aa  199  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  36.36 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  33.33 
 
 
436 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  34.41 
 
 
445 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  36.03 
 
 
482 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  36.34 
 
 
461 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  40.18 
 
 
447 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  33.86 
 
 
426 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  33.97 
 
 
456 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  34.91 
 
 
419 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  38.71 
 
 
426 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  34.5 
 
 
440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  35.89 
 
 
478 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  37.35 
 
 
490 aa  189  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  34.72 
 
 
420 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  34.21 
 
 
429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  35.45 
 
 
434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  36.53 
 
 
421 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  32.38 
 
 
426 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.16 
 
 
451 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  32.55 
 
 
430 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  35.11 
 
 
438 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  32.6 
 
 
459 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  31.52 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  35.31 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.45 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  33.68 
 
 
444 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  33.17 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  32.81 
 
 
426 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  31.73 
 
 
437 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  30.98 
 
 
447 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.55 
 
 
426 aa  160  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  32.21 
 
 
412 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.77 
 
 
441 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  32.89 
 
 
408 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.89 
 
 
408 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  32.89 
 
 
408 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  33.59 
 
 
459 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  33.93 
 
 
433 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  38.1 
 
 
408 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  34.14 
 
 
407 aa  156  8e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  34.27 
 
 
432 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  31.18 
 
 
444 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  32.63 
 
 
422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  32.17 
 
 
405 aa  154  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  30.29 
 
 
409 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  29.62 
 
 
428 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  31.16 
 
 
424 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  29.97 
 
 
431 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  33.33 
 
 
440 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.64 
 
 
434 aa  150  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  29.07 
 
 
431 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  29.49 
 
 
444 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.4 
 
 
423 aa  149  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  32.49 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  32.49 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  29.06 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  32.49 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  32 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.41 
 
 
407 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  32.98 
 
 
433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  33.24 
 
 
455 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  33.68 
 
 
419 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>