250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3014 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  100 
 
 
459 aa  951    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  39.3 
 
 
445 aa  271  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  36.12 
 
 
434 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  35.49 
 
 
490 aa  259  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  36.61 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  36.36 
 
 
436 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  37.56 
 
 
429 aa  246  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  35.01 
 
 
478 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  36.38 
 
 
433 aa  240  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  34.93 
 
 
420 aa  240  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  35.36 
 
 
444 aa  237  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  35.08 
 
 
461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  34.74 
 
 
456 aa  233  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  35.32 
 
 
447 aa  231  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  34.72 
 
 
451 aa  230  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  36.34 
 
 
440 aa  229  9e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  32.95 
 
 
486 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  35.37 
 
 
447 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  35.2 
 
 
412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  34.23 
 
 
412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  33.41 
 
 
426 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  31.74 
 
 
416 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  33.67 
 
 
413 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  31.58 
 
 
407 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  34.47 
 
 
411 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  32.66 
 
 
420 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  30.34 
 
 
482 aa  202  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  34.09 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  34.09 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  32.34 
 
 
412 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  30.55 
 
 
414 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  31.59 
 
 
447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  32.95 
 
 
411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  32.69 
 
 
436 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  28.81 
 
 
411 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  31.78 
 
 
419 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  31.56 
 
 
419 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  31.66 
 
 
425 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  29.29 
 
 
415 aa  182  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  28.64 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  29.15 
 
 
405 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  29.44 
 
 
413 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  29.86 
 
 
417 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  30.65 
 
 
425 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  32.6 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  29.79 
 
 
428 aa  172  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  29.88 
 
 
391 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  28.34 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  27.56 
 
 
406 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  29.44 
 
 
411 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.85 
 
 
430 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  27.83 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  29.69 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  28.84 
 
 
418 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  29.25 
 
 
409 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  29.9 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  26.68 
 
 
445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  29.09 
 
 
431 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  26.02 
 
 
438 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  27.17 
 
 
426 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  26.88 
 
 
421 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.03 
 
 
426 aa  133  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  28.38 
 
 
455 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  27.21 
 
 
423 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  26.2 
 
 
426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  27.52 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  26.69 
 
 
431 aa  126  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  29.72 
 
 
433 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  27.85 
 
 
444 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  26.61 
 
 
430 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  25.4 
 
 
445 aa  123  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  24.42 
 
 
459 aa  123  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  29.09 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  28.13 
 
 
444 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  25.38 
 
 
413 aa  121  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  25.28 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  26.9 
 
 
441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.42 
 
 
426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  26.08 
 
 
422 aa  118  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  25.71 
 
 
440 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  25.69 
 
 
433 aa  116  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  29.11 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  25.32 
 
 
426 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  26.05 
 
 
396 aa  113  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  26.28 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  26.21 
 
 
407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  27.4 
 
 
437 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  27.07 
 
 
407 aa  110  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  28.01 
 
 
390 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  24.15 
 
 
409 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.75 
 
 
434 aa  106  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  25.28 
 
 
424 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  25.56 
 
 
407 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  24.65 
 
 
417 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  24.65 
 
 
417 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  24.65 
 
 
417 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  25 
 
 
421 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  26.65 
 
 
403 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  25.72 
 
 
428 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>