More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0890 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  100 
 
 
412 aa  820    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  76.31 
 
 
436 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  76.06 
 
 
413 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  75.06 
 
 
420 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  74.5 
 
 
413 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  74.26 
 
 
413 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  77.05 
 
 
405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  68.14 
 
 
419 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  67.96 
 
 
419 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  57.78 
 
 
416 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  56.56 
 
 
411 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  57.39 
 
 
414 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  57.79 
 
 
415 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  52.48 
 
 
411 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  53.87 
 
 
413 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  51.86 
 
 
411 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  49.88 
 
 
417 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  49.88 
 
 
411 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  49.26 
 
 
405 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  49.88 
 
 
425 aa  355  6.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  51.66 
 
 
403 aa  353  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  49.15 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  49.02 
 
 
409 aa  335  7e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  49.04 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  42.54 
 
 
408 aa  322  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  43.87 
 
 
413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  45.61 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  46.76 
 
 
391 aa  302  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  43.35 
 
 
406 aa  300  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  44.12 
 
 
443 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  45.13 
 
 
428 aa  289  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  40.92 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  37.56 
 
 
412 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  37.68 
 
 
412 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  46.52 
 
 
393 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  42.82 
 
 
425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  36.93 
 
 
456 aa  243  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  39.48 
 
 
461 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  39.32 
 
 
486 aa  226  7e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  35.07 
 
 
420 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.81 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  37 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  36.28 
 
 
478 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  35.88 
 
 
490 aa  219  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  40.05 
 
 
447 aa  219  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  35.71 
 
 
419 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  34.22 
 
 
440 aa  216  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  36.79 
 
 
482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  36.9 
 
 
434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  33.49 
 
 
436 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  33.88 
 
 
445 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  34.92 
 
 
429 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  34.65 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  36.27 
 
 
426 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  34.15 
 
 
426 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  36.12 
 
 
421 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  32.11 
 
 
459 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  34.16 
 
 
445 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  32.69 
 
 
426 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  36.28 
 
 
440 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  34.61 
 
 
447 aa  189  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  33.58 
 
 
444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.89 
 
 
407 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  32.79 
 
 
413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  32.52 
 
 
405 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  31.68 
 
 
441 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  31.68 
 
 
431 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  33.57 
 
 
447 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  36.21 
 
 
408 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  32.85 
 
 
412 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.25 
 
 
430 aa  176  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  33.82 
 
 
438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  34.05 
 
 
432 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  32.71 
 
 
411 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  34.61 
 
 
422 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  33.17 
 
 
423 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  34.74 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  34.74 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  34.74 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  30.56 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  31.44 
 
 
428 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.38 
 
 
426 aa  167  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  33.33 
 
 
459 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  33.41 
 
 
433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  31.82 
 
 
431 aa  166  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  31.73 
 
 
444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  33.89 
 
 
429 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  33.73 
 
 
433 aa  163  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  33.33 
 
 
408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  33.33 
 
 
408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  33.33 
 
 
408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  30.85 
 
 
401 aa  163  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  31.31 
 
 
409 aa  163  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  33.61 
 
 
407 aa  162  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  30.75 
 
 
407 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  34.6 
 
 
414 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  33.66 
 
 
421 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  35.48 
 
 
419 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  32.43 
 
 
424 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  32.73 
 
 
437 aa  159  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>