256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2362 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  100 
 
 
413 aa  845    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  75.13 
 
 
391 aa  622  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  48.06 
 
 
425 aa  347  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  47.42 
 
 
407 aa  347  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  45.43 
 
 
406 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  46.17 
 
 
417 aa  343  5e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  45.15 
 
 
419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  43.83 
 
 
416 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  44.77 
 
 
419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  44.77 
 
 
414 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  44.71 
 
 
413 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  44.61 
 
 
411 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  45.78 
 
 
420 aa  316  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  43.87 
 
 
412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  43.69 
 
 
436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  43.93 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  42.48 
 
 
411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  43.69 
 
 
413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  43.2 
 
 
413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  42.14 
 
 
415 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  41.16 
 
 
408 aa  292  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  42.07 
 
 
411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  43.29 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  42.17 
 
 
411 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  41.86 
 
 
461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  44.14 
 
 
418 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  39.18 
 
 
425 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  37.02 
 
 
412 aa  270  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  36.54 
 
 
412 aa  269  7e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  43.7 
 
 
405 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  40.39 
 
 
405 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  39.56 
 
 
428 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  38.74 
 
 
409 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  42.04 
 
 
393 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  36.68 
 
 
436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  35.05 
 
 
433 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  38.35 
 
 
443 aa  237  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  35.68 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  35 
 
 
482 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  34.28 
 
 
486 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  35.15 
 
 
445 aa  219  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  34.12 
 
 
456 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  34.74 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  34.19 
 
 
429 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.33 
 
 
451 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  31.38 
 
 
444 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  34.95 
 
 
490 aa  206  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  31.92 
 
 
447 aa  206  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  33.8 
 
 
447 aa  206  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  33.25 
 
 
434 aa  206  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  30.42 
 
 
445 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  33.56 
 
 
426 aa  202  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  32.62 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  33.81 
 
 
432 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  32.39 
 
 
419 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  33.73 
 
 
461 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  33.89 
 
 
438 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  33.16 
 
 
430 aa  193  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.55 
 
 
407 aa  193  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  30.14 
 
 
426 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  34.25 
 
 
407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  31.4 
 
 
445 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  31.7 
 
 
420 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.56 
 
 
441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  32.94 
 
 
459 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  31.14 
 
 
426 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.24 
 
 
428 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  31.06 
 
 
431 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  28.64 
 
 
459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.51 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  36.26 
 
 
408 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.13 
 
 
426 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  34.33 
 
 
433 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  31.13 
 
 
405 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  31.92 
 
 
412 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  34.41 
 
 
433 aa  169  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  31.85 
 
 
447 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  31.5 
 
 
426 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  33.09 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.58 
 
 
431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  31.9 
 
 
409 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  31.9 
 
 
409 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  31.9 
 
 
409 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  32.98 
 
 
433 aa  162  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  32.92 
 
 
411 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  32.76 
 
 
408 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.76 
 
 
408 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  32.76 
 
 
408 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  33.5 
 
 
417 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  33.5 
 
 
417 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  33.5 
 
 
417 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  31.17 
 
 
444 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  32.02 
 
 
424 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  32.02 
 
 
444 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  31.07 
 
 
434 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  31.46 
 
 
428 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  29.95 
 
 
422 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.78 
 
 
430 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  32.24 
 
 
403 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  33.33 
 
 
402 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>