More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2354 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  100 
 
 
420 aa  850    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  81.66 
 
 
436 aa  698    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  94.38 
 
 
413 aa  779    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  95.68 
 
 
405 aa  721    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  92.74 
 
 
413 aa  780    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  94.62 
 
 
413 aa  783    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  75.06 
 
 
412 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  66.99 
 
 
419 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  66.99 
 
 
419 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  59.31 
 
 
416 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  56.76 
 
 
411 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  56.68 
 
 
415 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  53.58 
 
 
414 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  53.52 
 
 
413 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  49.88 
 
 
417 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  49.52 
 
 
425 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  47.56 
 
 
411 aa  358  9e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  49.61 
 
 
411 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  47.17 
 
 
411 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  47.67 
 
 
405 aa  353  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  51.46 
 
 
403 aa  351  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  51.9 
 
 
418 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  44.74 
 
 
408 aa  342  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  49.76 
 
 
461 aa  341  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  46.6 
 
 
409 aa  324  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  45.07 
 
 
407 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  45.78 
 
 
413 aa  316  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  45.29 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  43.69 
 
 
428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  41.36 
 
 
445 aa  301  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  44.91 
 
 
425 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  41.67 
 
 
406 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  43.32 
 
 
443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  37.26 
 
 
412 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  37.02 
 
 
412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  44.44 
 
 
393 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  37.47 
 
 
486 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  36 
 
 
433 aa  229  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  34.2 
 
 
436 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  36.45 
 
 
461 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  36.34 
 
 
490 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  36.17 
 
 
482 aa  219  7e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  36.95 
 
 
478 aa  219  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  33.49 
 
 
445 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  35.31 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  34.93 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  34.64 
 
 
440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  33.65 
 
 
445 aa  213  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  37.23 
 
 
426 aa  213  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  33.25 
 
 
426 aa  213  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  32.54 
 
 
456 aa  213  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  35.97 
 
 
434 aa  212  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  38.34 
 
 
447 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  35.83 
 
 
421 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  34.65 
 
 
429 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  36.17 
 
 
438 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  32.48 
 
 
413 aa  202  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  33.1 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  32.23 
 
 
430 aa  200  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  32.66 
 
 
459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  31.33 
 
 
451 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.46 
 
 
407 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  33.65 
 
 
447 aa  193  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  33.18 
 
 
412 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  33.79 
 
 
411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  34.2 
 
 
459 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  33.33 
 
 
408 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  33.33 
 
 
408 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  31.35 
 
 
431 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  31.11 
 
 
447 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  33.33 
 
 
408 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.92 
 
 
441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  34.35 
 
 
433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  30.68 
 
 
444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  34.55 
 
 
432 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.86 
 
 
430 aa  182  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.94 
 
 
428 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  32.79 
 
 
444 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  31.34 
 
 
409 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  33.81 
 
 
423 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  32.44 
 
 
405 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  29.81 
 
 
431 aa  177  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  31.23 
 
 
444 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  32.63 
 
 
437 aa  176  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.92 
 
 
407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  31.8 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.06 
 
 
426 aa  173  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  36.47 
 
 
408 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  34.12 
 
 
434 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  31.72 
 
 
421 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  31.34 
 
 
426 aa  170  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  32.17 
 
 
417 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  32.17 
 
 
417 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  32.17 
 
 
417 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  30.7 
 
 
424 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  29.47 
 
 
401 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  34.32 
 
 
440 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  31.25 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  32.49 
 
 
433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  33.26 
 
 
419 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>