299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1408 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  80.5 
 
 		 414 aa  670    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  83.25 
 
 		 417 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  78.75 
 
 		 429 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  100 
 
 		 402 aa  811    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  83.25 
 
 		 417 aa  660    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  83.71 
 
 		 424 aa  658    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  83.25 
 
 		 417 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  84 
 
 		 421 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  74.81 
 
 		 419 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  60.1 
 
 		 412 aa  478  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  59.35 
 
 		 411 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  59.1 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  59.1 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  59.35 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  59.1 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  55.36 
 
 		 403 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  54.7 
 
 		 404 aa  425  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  40.05 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  41.89 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  41.98 
 
 		 426 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  41.26 
 
 		 440 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  39.36 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  39.22 
 
 		 441 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  41.65 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  39.85 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  40.54 
 
 		 444 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  38.86 
 
 		 431 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  40.55 
 
 		 426 aa  243  6e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  38.71 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  40.29 
 
 		 459 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  39.44 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  37.34 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  37.66 
 
 		 433 aa  222  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  38.12 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  39.95 
 
 		 444 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  37.94 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  34.83 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  38.6 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  38.69 
 
 		 432 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  36.36 
 
 		 437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  37.84 
 
 		 433 aa  212  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  36.14 
 
 		 421 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  38.79 
 
 		 423 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  37.81 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  35.66 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  36.62 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  33.92 
 
 		 407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  34.96 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  34 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  33.99 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  37.09 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  34.79 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  33.57 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  32.93 
 
 		 431 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  35.57 
 
 		 480 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  33.92 
 
 		 470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  31.58 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  33.57 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  35.34 
 
 		 426 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  36.96 
 
 		 409 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  34 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.09 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  36.96 
 
 		 409 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  36.96 
 
 		 409 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  33.09 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  31.74 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  33.58 
 
 		 432 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  31.74 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  31.74 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  32.17 
 
 		 400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  32.6 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  31.41 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  32.44 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  32.66 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  33.5 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  32.93 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  31.63 
 
 		 410 aa  159  7e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  33 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  30.07 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  31.6 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  31.16 
 
 		 445 aa  155  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  31.97 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  32.06 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  32.91 
 
 		 419 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  30.51 
 
 		 408 aa  152  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  30.66 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  32.4 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  31.48 
 
 		 486 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  32.52 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  31.99 
 
 		 409 aa  149  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  33.17 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  30.07 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  31.43 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  31.44 
 
 		 447 aa  146  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  33.33 
 
 		 425 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  34.48 
 
 		 417 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  35.35 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  34.86 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  31.5 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  30.9 
 
 		 418 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>