282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4304 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  100 
 
 		 470 aa  959    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  39.71 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  38.48 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  37.91 
 
 		 434 aa  266  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  36.43 
 
 		 437 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  39.2 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  37.8 
 
 		 407 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  38.14 
 
 		 438 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  38.15 
 
 		 440 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  36.17 
 
 		 426 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  35.92 
 
 		 444 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  35.19 
 
 		 459 aa  233  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  36.62 
 
 		 433 aa  229  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  35.19 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  35.52 
 
 		 405 aa  226  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.74 
 
 		 426 aa  223  4e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  36.75 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  36.45 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  34.04 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  34.05 
 
 		 455 aa  206  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  33.81 
 
 		 441 aa  206  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  34.56 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  32.51 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  35.19 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  33.33 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  33.25 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  33.56 
 
 		 416 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  35.71 
 
 		 419 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  32.84 
 
 		 407 aa  186  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.72 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  34.51 
 
 		 412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  33.88 
 
 		 407 aa  182  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  33.66 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  34.34 
 
 		 415 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  34.5 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  32.33 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  36.36 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  33.65 
 
 		 409 aa  177  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  32.89 
 
 		 461 aa  177  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  33.75 
 
 		 421 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  33.67 
 
 		 408 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  33.67 
 
 		 408 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  33.67 
 
 		 408 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  32.75 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  32.75 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  33.92 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  32.75 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  33.33 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.9 
 
 		 407 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  34.52 
 
 		 414 aa  170  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  33.16 
 
 		 411 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  32.45 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  30.84 
 
 		 443 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  30.52 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  31.34 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  32.84 
 
 		 429 aa  166  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  30.84 
 
 		 419 aa  166  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  33.83 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  32.75 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  30.5 
 
 		 422 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  31.03 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  31.91 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  32.26 
 
 		 405 aa  162  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  30.29 
 
 		 426 aa  162  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  29.55 
 
 		 420 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  30.48 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  29.95 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.15 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  30.27 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  31.16 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  28.07 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  33.33 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  30.26 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  30.89 
 
 		 426 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  29.17 
 
 		 401 aa  156  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  31.47 
 
 		 413 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  30.17 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  29.55 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  29.55 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  30.89 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  31.35 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  31.03 
 
 		 418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  31.05 
 
 		 444 aa  153  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  33.96 
 
 		 403 aa  153  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  31.89 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  28.29 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  35.29 
 
 		 408 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  30.77 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  30.42 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  29.1 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  28.24 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  29.27 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  32 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  30.07 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  31.04 
 
 		 478 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  30.63 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  29.76 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  30.86 
 
 		 409 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  30.86 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  29.16 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>