More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2932 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  100 
 
 		 431 aa  883    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  33.96 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  34.02 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  36.43 
 
 		 440 aa  202  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  36.6 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  33.97 
 
 		 411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  33.01 
 
 		 430 aa  190  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  34.17 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  33.49 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  33.41 
 
 		 412 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  33.1 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  32.78 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  33.26 
 
 		 445 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  33.25 
 
 		 424 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  33.72 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  33.49 
 
 		 421 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  33.49 
 
 		 455 aa  179  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  32.54 
 
 		 421 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  34.04 
 
 		 408 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  34.04 
 
 		 408 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  34.04 
 
 		 408 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  32.55 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  32.78 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  32.93 
 
 		 402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  31.98 
 
 		 426 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.6 
 
 		 430 aa  173  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  36 
 
 		 407 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  32.69 
 
 		 402 aa  172  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  31.93 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  32.45 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  34.13 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.59 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  32.14 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  31.58 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  31.58 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  31.58 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  31.76 
 
 		 431 aa  166  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  31.16 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  32.08 
 
 		 437 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  30.29 
 
 		 438 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  29.95 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.33 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  31.54 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  32.8 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  31.57 
 
 		 404 aa  160  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  32.07 
 
 		 444 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  32.06 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  30.37 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  30.14 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  31.56 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  29.05 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  30.14 
 
 		 400 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  29.03 
 
 		 415 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  30.42 
 
 		 470 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  30.07 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  30.09 
 
 		 480 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  32.76 
 
 		 396 aa  146  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  30.14 
 
 		 434 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  33.07 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  30.1 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  28.97 
 
 		 410 aa  144  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  30.1 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  31 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  30.48 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  29.86 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  29.67 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  30.33 
 
 		 419 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  27.59 
 
 		 409 aa  136  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  28.27 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  31.95 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  29.49 
 
 		 416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  29.67 
 
 		 407 aa  133  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  27.38 
 
 		 417 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  29.23 
 
 		 407 aa  133  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  28.67 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  29.6 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  28.77 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  30.14 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  27.71 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  28.67 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  29.6 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  28.71 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  28.29 
 
 		 411 aa  127  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  28.64 
 
 		 461 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  29.16 
 
 		 421 aa  126  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  25.46 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  28.43 
 
 		 478 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  23.4 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  28.34 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  26.13 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.96 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  30.41 
 
 		 425 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  29.64 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  29.46 
 
 		 414 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  29.95 
 
 		 438 aa  119  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  29 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  29.64 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  28.24 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  28.47 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>