291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0935 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  100 
 
 
428 aa  864    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  62.41 
 
 
426 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  58.98 
 
 
422 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  46.42 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  45.95 
 
 
444 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  40.8 
 
 
430 aa  293  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  39.53 
 
 
441 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  40.94 
 
 
426 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  37.91 
 
 
431 aa  272  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  39.8 
 
 
405 aa  270  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  40.14 
 
 
459 aa  262  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  40.39 
 
 
440 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  39.55 
 
 
438 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  38 
 
 
423 aa  256  6e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  43.14 
 
 
444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  38.24 
 
 
426 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  38.26 
 
 
455 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  39.43 
 
 
433 aa  238  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  37.47 
 
 
430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  38.16 
 
 
432 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  36.19 
 
 
428 aa  226  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  34.87 
 
 
431 aa  219  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.89 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  37.81 
 
 
433 aa  217  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  35.42 
 
 
407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  35.66 
 
 
433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  34.86 
 
 
444 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  37.2 
 
 
419 aa  212  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  37.2 
 
 
421 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  37.68 
 
 
424 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  35.63 
 
 
412 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  35.28 
 
 
417 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  35.28 
 
 
417 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  35.28 
 
 
417 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  36.78 
 
 
429 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  36.3 
 
 
402 aa  206  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  34.39 
 
 
408 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  34.39 
 
 
408 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  34.39 
 
 
408 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  36.19 
 
 
414 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  34.38 
 
 
437 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  36.62 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  34.99 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  34.15 
 
 
411 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  39.11 
 
 
423 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  36.54 
 
 
407 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  34.11 
 
 
434 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  33.17 
 
 
409 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  37.47 
 
 
421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  33.25 
 
 
400 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  33.74 
 
 
403 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  33.25 
 
 
404 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  33.33 
 
 
423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  34.9 
 
 
413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  35.62 
 
 
426 aa  183  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  34.13 
 
 
432 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  34.09 
 
 
407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  32.02 
 
 
470 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  33.8 
 
 
480 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  31.6 
 
 
401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  32.7 
 
 
417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  34.05 
 
 
410 aa  159  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  31.46 
 
 
413 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  31.06 
 
 
419 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  34.18 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  29.88 
 
 
428 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  30.52 
 
 
412 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  31.16 
 
 
423 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  29.81 
 
 
416 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  31.16 
 
 
423 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  30.59 
 
 
486 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  30.59 
 
 
419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  31.65 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  32.98 
 
 
415 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  29.88 
 
 
425 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  30.5 
 
 
391 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  30.68 
 
 
446 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  32.56 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  31.33 
 
 
428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  28.54 
 
 
407 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  29.06 
 
 
406 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  29.67 
 
 
436 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  27.96 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  29.76 
 
 
443 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  27.7 
 
 
411 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  32.89 
 
 
461 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  27.73 
 
 
412 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  27.87 
 
 
431 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  29.82 
 
 
434 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  30.42 
 
 
413 aa  136  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  27.18 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  31.93 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  30.27 
 
 
432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  30.11 
 
 
456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  32.35 
 
 
408 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  32.14 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  29.61 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0275  amidohydrolase  30.75 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362841 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  28.92 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  31.5 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>