257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5037 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  100 
 
 
432 aa  881    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  58.13 
 
 
426 aa  481  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  38.19 
 
 
440 aa  219  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  38.41 
 
 
430 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  36.23 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  34.47 
 
 
445 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  37.77 
 
 
426 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  36.98 
 
 
426 aa  207  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  37.97 
 
 
419 aa  206  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  36.34 
 
 
455 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  36.5 
 
 
480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  34.62 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  38.32 
 
 
431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  34.23 
 
 
426 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  33.33 
 
 
421 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  35.48 
 
 
444 aa  189  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  35.52 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  35.52 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  35.52 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  34.77 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  35.77 
 
 
437 aa  183  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  35.15 
 
 
430 aa  183  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  34.08 
 
 
407 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  35.68 
 
 
459 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  34.13 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  35.54 
 
 
422 aa  179  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  32.64 
 
 
438 aa  179  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  33.18 
 
 
407 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  32.51 
 
 
441 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  33.82 
 
 
405 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  37.11 
 
 
433 aa  176  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  33.5 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  31.76 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  33.51 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.97 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  34.91 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  34.92 
 
 
411 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  32.77 
 
 
429 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  34.76 
 
 
444 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  33.5 
 
 
417 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  33.5 
 
 
417 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  33.59 
 
 
421 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  33.5 
 
 
417 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  32.5 
 
 
404 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  34.26 
 
 
423 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  32.91 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  33.01 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  33.59 
 
 
424 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  33.17 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.8 
 
 
434 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  34.86 
 
 
432 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  33.49 
 
 
416 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  32.53 
 
 
407 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  32.6 
 
 
415 aa  150  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  34.03 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.53 
 
 
428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  32.92 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  33.86 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  32 
 
 
470 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  31.54 
 
 
433 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  31.49 
 
 
440 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  32.02 
 
 
414 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  31 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  31.93 
 
 
417 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  30.7 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  31.92 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  30.68 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  32.09 
 
 
393 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  30.9 
 
 
401 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  32.11 
 
 
413 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  32.45 
 
 
428 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  30.59 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  31.84 
 
 
413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  33.25 
 
 
444 aa  136  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  31.58 
 
 
420 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  33.85 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  30.77 
 
 
424 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  29.7 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  31.49 
 
 
413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  28.74 
 
 
412 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  32.02 
 
 
413 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  31.14 
 
 
425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  30.29 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  29.02 
 
 
409 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  29.98 
 
 
445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  31.01 
 
 
391 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  31.8 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  29.81 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  29.93 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  28.03 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.74 
 
 
411 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  28.42 
 
 
408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  30.16 
 
 
478 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  28.6 
 
 
446 aa  126  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  30.34 
 
 
405 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  29.35 
 
 
443 aa  123  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  31.83 
 
 
405 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  30.14 
 
 
411 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  31.26 
 
 
407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  28.27 
 
 
423 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>