284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2515 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  100 
 
 
426 aa  843    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  58.13 
 
 
432 aa  481  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  38.03 
 
 
421 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  37.86 
 
 
426 aa  227  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  39.13 
 
 
423 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  38.74 
 
 
455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  41.31 
 
 
440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  36.81 
 
 
430 aa  216  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  34.64 
 
 
445 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  35.37 
 
 
431 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  33.18 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  34.55 
 
 
433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  34.24 
 
 
437 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.56 
 
 
426 aa  196  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  33.87 
 
 
438 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  34.78 
 
 
444 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  37.47 
 
 
419 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  35.99 
 
 
433 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  32.86 
 
 
413 aa  186  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  32.78 
 
 
423 aa  186  9e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  37.8 
 
 
426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  33.51 
 
 
407 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  31.93 
 
 
431 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  35.71 
 
 
480 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.22 
 
 
434 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  34.98 
 
 
405 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  34.31 
 
 
421 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  36.41 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  35.83 
 
 
422 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  34.64 
 
 
407 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  34.45 
 
 
407 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  37.25 
 
 
424 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  36.79 
 
 
414 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  34.25 
 
 
444 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  36.49 
 
 
421 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  35.41 
 
 
417 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  35.41 
 
 
417 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  35.41 
 
 
417 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  32.05 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  35.37 
 
 
402 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  33.17 
 
 
432 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  33.33 
 
 
470 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  35.41 
 
 
411 aa  169  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  32.54 
 
 
459 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  32.47 
 
 
441 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  33.65 
 
 
411 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  37.47 
 
 
415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  34.38 
 
 
429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  29.71 
 
 
432 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  35.8 
 
 
412 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  29.33 
 
 
431 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  33.86 
 
 
433 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  36.34 
 
 
408 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  36.34 
 
 
408 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  36.34 
 
 
408 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  32.21 
 
 
411 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  32.76 
 
 
411 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  33.17 
 
 
416 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  32.35 
 
 
428 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  32.8 
 
 
443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  30.63 
 
 
445 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  33.03 
 
 
434 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  36.56 
 
 
412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  33.57 
 
 
414 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  33.96 
 
 
425 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  33.26 
 
 
478 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  31.77 
 
 
409 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  33.57 
 
 
413 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  32.46 
 
 
423 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  32.78 
 
 
405 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  29.41 
 
 
412 aa  150  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  32.23 
 
 
419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.33 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  32.68 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  29.08 
 
 
412 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  32.94 
 
 
413 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  35.57 
 
 
402 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  33.57 
 
 
461 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  33.74 
 
 
403 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  31.99 
 
 
419 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  31.11 
 
 
406 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  33 
 
 
413 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  32.86 
 
 
420 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  29.21 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  29.36 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  27.99 
 
 
490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  30.58 
 
 
396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  31.91 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  31.76 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  31.75 
 
 
456 aa  141  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  33.01 
 
 
409 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  33.01 
 
 
409 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  33.01 
 
 
409 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  29.56 
 
 
440 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  31.55 
 
 
486 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  30.3 
 
 
482 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  30.83 
 
 
411 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  33.33 
 
 
390 aa  136  9e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  33.33 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  30.38 
 
 
423 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>