More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2475 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  100 
 
 		 397 aa  751    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  43.42 
 
 		 381 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  43.18 
 
 		 381 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  36.07 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  43.77 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  32.31 
 
 		 480 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  30.37 
 
 		 456 aa  116  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  25.51 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  25.95 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  26.03 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  29.3 
 
 		 686 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.01 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  27.46 
 
 		 426 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  26.02 
 
 		 455 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  28.87 
 
 		 666 aa  93.2  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  27.8 
 
 		 423 aa  92.8  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  30.73 
 
 		 413 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  25.71 
 
 		 432 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  30.79 
 
 		 470 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  27.31 
 
 		 702 aa  90.1  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  30.71 
 
 		 438 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  30.12 
 
 		 401 aa  86.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  27.06 
 
 		 585 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  30.35 
 
 		 1031 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  26.7 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  26.91 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  30.33 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  30.33 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  25.59 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  30.33 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  29.79 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  26.59 
 
 		 430 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.59 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  28.77 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  23.45 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  26.08 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  25.35 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  22.98 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  29.86 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  27.76 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  27.27 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  29.87 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  25.69 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  28.19 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  25.23 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  45.26 
 
 		 512 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  30.28 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0533658 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  23.89 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  27.06 
 
 		 680 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  28.85 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  26.54 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.29 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  31.13 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  29.67 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.76 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  27.19 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  27.59 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0846  amidohydrolase  24.94 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  22.98 
 
 		 672 aa  73.2  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  27.73 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  29.19 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  29 
 
 		 1059 aa  73.2  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  24.45 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  27.21 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  42.48 
 
 		 1005 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  24.7 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  22.49 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.67 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  26.56 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0963  amidohydrolase  26.14 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.296396  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  29.07 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  27.15 
 
 		 692 aa  70.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  26.62 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  31.39 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  29.45 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  27.25 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  29.45 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  29.45 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  24.53 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  26.4 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  25.31 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  25.84 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  24.57 
 
 		 1071 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  27.19 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  27.23 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  27.89 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  24.76 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  28.96 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  22.8 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  22.8 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  29.18 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  28.16 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  24.37 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  23.81 
 
 		 1084 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  29.32 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2275  amidohydrolase  24.15 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.776694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  26.7 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  31.44 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  32 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  25.85 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>