More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11210 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  100 
 
 
456 aa  912    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  53.13 
 
 
480 aa  441  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  42.19 
 
 
441 aa  350  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  40.62 
 
 
435 aa  332  9e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  33.41 
 
 
568 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  28.72 
 
 
585 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  32.55 
 
 
432 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.61 
 
 
407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  32.2 
 
 
438 aa  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  30.09 
 
 
426 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  30.84 
 
 
438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  29.64 
 
 
433 aa  127  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  30.49 
 
 
459 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  29.03 
 
 
444 aa  123  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.45 
 
 
430 aa  123  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  27.36 
 
 
401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  29.36 
 
 
455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  29.07 
 
 
483 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  28.28 
 
 
415 aa  120  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  30.28 
 
 
666 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  28.73 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  28.51 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  27.27 
 
 
415 aa  117  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.356604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  28.92 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  28.51 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  29.82 
 
 
686 aa  113  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  31.26 
 
 
381 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  27.55 
 
 
409 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  26.25 
 
 
426 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  26.21 
 
 
432 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.6 
 
 
445 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  27.46 
 
 
428 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  28.08 
 
 
441 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  28.41 
 
 
440 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  27.29 
 
 
430 aa  103  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  30.37 
 
 
397 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  29.2 
 
 
447 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  27.44 
 
 
423 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  26.4 
 
 
426 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  27.15 
 
 
433 aa  99.8  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  26.94 
 
 
426 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  27.95 
 
 
419 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  26.02 
 
 
432 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  27.09 
 
 
409 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  26.21 
 
 
400 aa  97.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  28.25 
 
 
402 aa  96.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  27.96 
 
 
1005 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  31.34 
 
 
426 aa  96.3  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  27.41 
 
 
409 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  27.41 
 
 
409 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  26.46 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  28.67 
 
 
409 aa  94  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  25.93 
 
 
431 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  28.96 
 
 
819 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  27.39 
 
 
421 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  26.56 
 
 
422 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  27.34 
 
 
438 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  27.15 
 
 
480 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  24.5 
 
 
1084 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  25.99 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  31.28 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  26.86 
 
 
431 aa  91.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  28.44 
 
 
470 aa  91.3  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  26.71 
 
 
511 aa  91.3  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30.39 
 
 
402 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  25.68 
 
 
407 aa  90.9  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  25.54 
 
 
410 aa  89.7  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  30.05 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  27.27 
 
 
485 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  28.64 
 
 
403 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  27.36 
 
 
408 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  27.36 
 
 
408 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  27.36 
 
 
408 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  26.86 
 
 
428 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  26.9 
 
 
424 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  27.04 
 
 
490 aa  86.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  26.77 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  26.77 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  26.59 
 
 
1062 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  26.77 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  25.7 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  27.53 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  24.16 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  28.37 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  25.86 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  25.21 
 
 
540 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  27.01 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.16 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  27.85 
 
 
429 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  26.98 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.17 
 
 
434 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  27.53 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  28.94 
 
 
351 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  25.74 
 
 
680 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  27.69 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  27.31 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  25.72 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  25.12 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  21.85 
 
 
451 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  27.06 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>