More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1098 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  45.03 
 
 		 1071 aa  977    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  44.62 
 
 		 1049 aa  984    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  44.42 
 
 		 1062 aa  977    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  46.18 
 
 		 1067 aa  1018    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  46.43 
 
 		 1062 aa  1013    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  45.28 
 
 		 1081 aa  986    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  44.91 
 
 		 1066 aa  994    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  41.4 
 
 		 1084 aa  890    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  46.43 
 
 		 1062 aa  1012    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  45.18 
 
 		 1065 aa  986    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  47.12 
 
 		 1138 aa  979    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  46.02 
 
 		 1069 aa  999    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  46.29 
 
 		 1062 aa  1002    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  100 
 
 		 1078 aa  2188    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  46.33 
 
 		 1062 aa  1008    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  43.12 
 
 		 1113 aa  919    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  44.8 
 
 		 1062 aa  983    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  44.61 
 
 		 1062 aa  984    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  44.95 
 
 		 1060 aa  997    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  55.72 
 
 		 1062 aa  1223    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  44.92 
 
 		 1062 aa  990    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  42.33 
 
 		 1111 aa  890    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  43.56 
 
 		 598 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  50.72 
 
 		 445 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  30.61 
 
 		 1052 aa  411  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  27.43 
 
 		 1059 aa  224  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1042 aa  212  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  25.33 
 
 		 1040 aa  211  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  25.23 
 
 		 1042 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.27 
 
 		 1005 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  24.27 
 
 		 1014 aa  164  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  24.04 
 
 		 1031 aa  142  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  28.64 
 
 		 666 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  28.67 
 
 		 1010 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  26.65 
 
 		 1167 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.6 
 
 		 717 aa  99  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  26.43 
 
 		 1097 aa  97.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  28.26 
 
 		 470 aa  92.8  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  24.95 
 
 		 1067 aa  91.7  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  24.44 
 
 		 568 aa  89.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  24.7 
 
 		 407 aa  87.4  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  24.15 
 
 		 648 aa  84.7  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  23.97 
 
 		 1090 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.42 
 
 		 432 aa  84.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  26.49 
 
 		 478 aa  83.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  22.52 
 
 		 1075 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  28.44 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  24.94 
 
 		 459 aa  80.9  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  25.6 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.16 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.16 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.86 
 
 		 670 aa  78.2  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  25.12 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  28.64 
 
 		 354 aa  76.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.92 
 
 		 446 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  24.4 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  27.47 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  22.7 
 
 		 1084 aa  75.9  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  27.47 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  25.68 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  27.66 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.84 
 
 		 674 aa  75.1  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  24.57 
 
 		 1082 aa  75.1  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  24.32 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  28.89 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  27.06 
 
 		 674 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  24.07 
 
 		 483 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  33.95 
 
 		 441 aa  74.3  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  25.06 
 
 		 456 aa  73.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  32.72 
 
 		 445 aa  73.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.78 
 
 		 430 aa  73.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  25.99 
 
 		 441 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  32.3 
 
 		 432 aa  73.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  29.91 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.92 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  25.8 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  24.77 
 
 		 572 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  29.6 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  23.29 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  26.44 
 
 		 435 aa  72  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  23.91 
 
 		 426 aa  72  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  24.14 
 
 		 694 aa  71.6  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1561  WD40 domain-containing protein  25.2 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  30.36 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  23.89 
 
 		 407 aa  70.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  28.45 
 
 		 646 aa  71.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  29.15 
 
 		 432 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  21.6 
 
 		 672 aa  70.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.33 
 
 		 445 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  31.17 
 
 		 429 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  29.91 
 
 		 430 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  24.71 
 
 		 702 aa  70.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  30.12 
 
 		 453 aa  70.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  32.49 
 
 		 444 aa  70.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  26.09 
 
 		 448 aa  70.5  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  30.07 
 
 		 354 aa  70.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.12 
 
 		 590 aa  70.1  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.19 
 
 		 674 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  33.12 
 
 		 444 aa  70.1  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>