274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1561 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1561  WD40 domain-containing protein  100 
 
 		 375 aa  776    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  32.21 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2260  WD40 domain-containing protein  29.06 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1447  WD40 domain protein beta Propeller  27.49 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000967065  normal  0.55523 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  25 
 
 		 1111 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.07 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  28.04 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  26.16 
 
 		 1065 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  26.06 
 
 		 1049 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.93 
 
 		 429 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  31.9 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.94 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  25.2 
 
 		 1078 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  25.76 
 
 		 1066 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  26.06 
 
 		 1062 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  29.19 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  27.72 
 
 		 1081 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  25.73 
 
 		 1062 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  26.06 
 
 		 1062 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  27.05 
 
 		 1067 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  25.81 
 
 		 1071 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  25.73 
 
 		 1062 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  25.73 
 
 		 1062 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  27 
 
 		 1113 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  27.72 
 
 		 1069 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  25.08 
 
 		 1062 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  25.49 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  27.23 
 
 		 1060 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  25.25 
 
 		 1062 aa  67  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  28.04 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  26.32 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  26.89 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  26.1 
 
 		 969 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.24 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  29.19 
 
 		 1062 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  22.83 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  27.86 
 
 		 572 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  23.23 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1042 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  23.23 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.9 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  24.65 
 
 		 567 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  24.25 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  22.67 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  23.2 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  24.82 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  26.15 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  22.22 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 		 646 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.17 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.58 
 
 		 1138 aa  59.7  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  26.26 
 
 		 434 aa  59.3  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.18 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  26.3 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  32.24 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.09 
 
 		 1097 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  23.58 
 
 		 1062 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  25.46 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  24.32 
 
 		 1040 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.59 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  24.81 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  25.52 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  28.83 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  24.44 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  24.41 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  24.41 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  23.2 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  28.25 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  24.02 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.92 
 
 		 1005 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3925  WD40 domain protein beta Propeller  32.62 
 
 		 647 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329588  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  24.24 
 
 		 676 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  23.65 
 
 		 1042 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  21.99 
 
 		 354 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  22.88 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.79 
 
 		 292 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  20.06 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  26.03 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  23.7 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  23.7 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  23.89 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  26.26 
 
 		 970 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  24.28 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02818  conserved hypothetical protein  29.66 
 
 		 679 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  23.9 
 
 		 442 aa  53.9  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  23.7 
 
 		 474 aa  53.9  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  22.64 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  24.66 
 
 		 469 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6060  WD40 domain protein beta Propeller  25.89 
 
 		 510 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  25.38 
 
 		 438 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  27.46 
 
 		 420 aa  53.1  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  23.7 
 
 		 439 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  33.33 
 
 		 440 aa  53.1  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  24.4 
 
 		 434 aa  53.1  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.63 
 
 		 1082 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.15 
 
 		 367 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.59 
 
 		 594 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>