More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2416 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  100 
 
 		 453 aa  908    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  50.33 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  49.08 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  49.33 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  48.74 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  47.91 
 
 		 443 aa  418  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  48.47 
 
 		 450 aa  418  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  48.35 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  48.32 
 
 		 450 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  48.13 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  49.45 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  49.45 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  48.94 
 
 		 450 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  49.01 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  48.03 
 
 		 449 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  48.03 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  48.78 
 
 		 439 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  47.8 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  48.58 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  46.17 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  46.84 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  43.62 
 
 		 445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  43.18 
 
 		 441 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  43.26 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  43.26 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  43.26 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  42.57 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  40.95 
 
 		 448 aa  322  9.000000000000001e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  42.92 
 
 		 439 aa  319  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  40.36 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  41.39 
 
 		 461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  40.81 
 
 		 454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  41.51 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  39.91 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  40.14 
 
 		 462 aa  300  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  42.18 
 
 		 461 aa  299  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  39.16 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  38.95 
 
 		 446 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  39.44 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  39.44 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  39.29 
 
 		 451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  36.76 
 
 		 450 aa  276  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  32.58 
 
 		 420 aa  253  5.000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  32.6 
 
 		 434 aa  223  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.66 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  31.5 
 
 		 427 aa  213  5.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  33.55 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  32.19 
 
 		 415 aa  209  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  33.1 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  32.51 
 
 		 429 aa  206  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  32.58 
 
 		 441 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  32.3 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.79 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  30.79 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  32.63 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  32.53 
 
 		 441 aa  196  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  31.72 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  30.42 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  31.97 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.94 
 
 		 432 aa  194  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  32.39 
 
 		 440 aa  193  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  31.37 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  29.33 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.11 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  31.5 
 
 		 439 aa  190  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  32.95 
 
 		 432 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  32.16 
 
 		 425 aa  189  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  31.98 
 
 		 445 aa  189  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  31.81 
 
 		 434 aa  189  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  31.92 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  31.51 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  29.41 
 
 		 450 aa  187  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  30.48 
 
 		 433 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  29.01 
 
 		 432 aa  186  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  30.48 
 
 		 431 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  30.48 
 
 		 433 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  32.49 
 
 		 427 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  30.48 
 
 		 463 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  30.77 
 
 		 437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  32.63 
 
 		 408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  30.39 
 
 		 403 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  30.26 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  30.26 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  29.61 
 
 		 435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  30.26 
 
 		 463 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  29.87 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  30.31 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  28.97 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.62 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  30.26 
 
 		 463 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  30.3 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  30.13 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  29.87 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  29.87 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.66 
 
 		 407 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 446 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  29.26 
 
 		 436 aa  180  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  29.91 
 
 		 439 aa  179  7e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  29.42 
 
 		 431 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  29.91 
 
 		 430 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>