More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1094 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  100 
 
 
443 aa  903    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  63.23 
 
 
446 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  61.31 
 
 
436 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  61.38 
 
 
435 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  59.95 
 
 
450 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  60.32 
 
 
435 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  57.47 
 
 
450 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  58.47 
 
 
450 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  59.77 
 
 
443 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  58.84 
 
 
443 aa  512  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  59.07 
 
 
443 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  57.08 
 
 
450 aa  511  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  59.29 
 
 
444 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  59.91 
 
 
435 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  58.57 
 
 
449 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  58.51 
 
 
439 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  58.33 
 
 
449 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  56.97 
 
 
462 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  56.07 
 
 
441 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  54.55 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  52.91 
 
 
448 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  52.38 
 
 
446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  54.44 
 
 
439 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  52.42 
 
 
445 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  52.53 
 
 
444 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  52.53 
 
 
444 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  49.42 
 
 
441 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  49.33 
 
 
453 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  52.29 
 
 
444 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  49.09 
 
 
442 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  47.71 
 
 
469 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  47.69 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  49.75 
 
 
442 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  49.42 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  48.2 
 
 
446 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  48.2 
 
 
446 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  49.28 
 
 
462 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  49.09 
 
 
461 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  47.54 
 
 
454 aa  388  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  48.05 
 
 
461 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  47.32 
 
 
451 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  42.42 
 
 
450 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  36.32 
 
 
420 aa  320  3.9999999999999996e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.47 
 
 
422 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  36.47 
 
 
422 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  34.33 
 
 
434 aa  250  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  36.19 
 
 
439 aa  249  8e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  36.72 
 
 
439 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  35.15 
 
 
424 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  32.48 
 
 
426 aa  243  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  32.81 
 
 
432 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  35.68 
 
 
433 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  35.68 
 
 
433 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  33.8 
 
 
442 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  34.86 
 
 
435 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  35.88 
 
 
443 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  33.71 
 
 
445 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.65 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  32.61 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  33.33 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  33.72 
 
 
433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  32.08 
 
 
425 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  33.95 
 
 
423 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  33.95 
 
 
423 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  31.94 
 
 
428 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  34.94 
 
 
432 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  32.08 
 
 
421 aa  230  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  32.13 
 
 
429 aa  229  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  32.34 
 
 
436 aa  229  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  34.07 
 
 
435 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  32.72 
 
 
441 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  36.08 
 
 
432 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  33.72 
 
 
423 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  36.08 
 
 
432 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  32.02 
 
 
443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  33 
 
 
421 aa  226  6e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  34.68 
 
 
432 aa  226  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  34.29 
 
 
414 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  33.56 
 
 
439 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  34.49 
 
 
427 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  32.31 
 
 
427 aa  223  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  35 
 
 
430 aa  222  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  32.87 
 
 
474 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  33.57 
 
 
446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  32.41 
 
 
440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  30.82 
 
 
451 aa  220  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  32 
 
 
438 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.49 
 
 
432 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  32.93 
 
 
436 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  34.98 
 
 
434 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  33.18 
 
 
408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  34.73 
 
 
434 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  31.33 
 
 
427 aa  217  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  30.97 
 
 
451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  33.18 
 
 
431 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  31.55 
 
 
437 aa  216  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.8 
 
 
428 aa  216  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  32.52 
 
 
403 aa  216  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  33.03 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  33.03 
 
 
433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>