More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4147 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  80.64 
 
 		 462 aa  722    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  88.51 
 
 		 450 aa  811    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  97.33 
 
 		 449 aa  867    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  86.43 
 
 		 450 aa  794    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  100 
 
 		 449 aa  915    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  87.28 
 
 		 450 aa  805    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  95.5 
 
 		 444 aa  842    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  69.83 
 
 		 450 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  64.03 
 
 		 436 aa  594  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  65.19 
 
 		 443 aa  590  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  64.95 
 
 		 443 aa  588  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  64.72 
 
 		 443 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  64.91 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  65.44 
 
 		 435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  61.35 
 
 		 448 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  63.23 
 
 		 446 aa  561  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  62.53 
 
 		 435 aa  558  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  63.47 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  57.71 
 
 		 443 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  56.85 
 
 		 442 aa  504  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  60.49 
 
 		 442 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  58.27 
 
 		 442 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  54.95 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  55.92 
 
 		 441 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  55.42 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  55.42 
 
 		 446 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  54.23 
 
 		 445 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  52.7 
 
 		 446 aa  458  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  51.23 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  52.4 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  52.16 
 
 		 444 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  52.16 
 
 		 444 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  51.29 
 
 		 441 aa  435  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  47.01 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  49.88 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  45.17 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  47.22 
 
 		 461 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  48.18 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  44.72 
 
 		 461 aa  355  8.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  45.45 
 
 		 451 aa  351  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  44.33 
 
 		 454 aa  340  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  40.48 
 
 		 450 aa  324  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  38.39 
 
 		 420 aa  301  2e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  35.48 
 
 		 415 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  34.29 
 
 		 441 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  33.41 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  35.65 
 
 		 434 aa  250  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  34.11 
 
 		 429 aa  249  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  34.35 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  33.71 
 
 		 427 aa  247  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  34.71 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  35.44 
 
 		 421 aa  243  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  33.55 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  33.41 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  34.13 
 
 		 425 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  35.52 
 
 		 439 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  33.82 
 
 		 437 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  31.54 
 
 		 436 aa  236  7e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  35.11 
 
 		 422 aa  236  7e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.11 
 
 		 422 aa  236  7e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  31.53 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  32.04 
 
 		 428 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  33.81 
 
 		 435 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  35.28 
 
 		 425 aa  233  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  34.75 
 
 		 424 aa  232  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  31.94 
 
 		 457 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.27 
 
 		 428 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  32.93 
 
 		 427 aa  229  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  33.65 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  34.67 
 
 		 427 aa  227  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  32.85 
 
 		 408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  33.49 
 
 		 439 aa  226  7e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  32.89 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  32.96 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  32.96 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  33.09 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  32.96 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  32.03 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  32.74 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  32.79 
 
 		 432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  31 
 
 		 442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  33.25 
 
 		 474 aa  223  6e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  32.74 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  32.74 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  32.74 
 
 		 463 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.94 
 
 		 446 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  32.78 
 
 		 434 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  34.93 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  31.57 
 
 		 433 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  32.27 
 
 		 430 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  32.88 
 
 		 430 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  32.46 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  32.46 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  37.13 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  32.65 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  32.46 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  36.44 
 
 		 432 aa  217  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  28.81 
 
 		 432 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  32.13 
 
 		 423 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>