More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0669 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  100 
 
 		 444 aa  890    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  72.46 
 
 		 446 aa  645    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  96.17 
 
 		 444 aa  825    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  100 
 
 		 444 aa  890    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  69.95 
 
 		 441 aa  627  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  71.53 
 
 		 445 aa  621  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  68.71 
 
 		 461 aa  586  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  51.59 
 
 		 446 aa  450  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  52.05 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  53.46 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  52.25 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  52.64 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  51.29 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  51.82 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  52.16 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  51.35 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  51.44 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  51.58 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  52.71 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  51.68 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  51.54 
 
 		 450 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  49.88 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  50 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  48.76 
 
 		 439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  48.87 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  47.39 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  50.48 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  46.21 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  47.65 
 
 		 446 aa  358  8e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  45.06 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  47.06 
 
 		 442 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  47.56 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  42.6 
 
 		 453 aa  345  8.999999999999999e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  43.88 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  47 
 
 		 446 aa  342  9e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  47 
 
 		 446 aa  342  9e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  43.45 
 
 		 454 aa  341  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  44.11 
 
 		 451 aa  332  9e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  44.44 
 
 		 462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  41.19 
 
 		 469 aa  326  5e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  43.1 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  37.35 
 
 		 450 aa  299  5e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  37.3 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  34.21 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  34.05 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  34.55 
 
 		 422 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.55 
 
 		 422 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  31.31 
 
 		 457 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  35.49 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  34.69 
 
 		 435 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  32.13 
 
 		 434 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  34.61 
 
 		 435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  30.11 
 
 		 432 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.5 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  32.11 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.25 
 
 		 430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  34.19 
 
 		 424 aa  211  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 436 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  33.1 
 
 		 432 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  31.93 
 
 		 433 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  31.93 
 
 		 433 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  33.1 
 
 		 414 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  32.64 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  34.62 
 
 		 439 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  32.56 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  33.81 
 
 		 446 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  32.2 
 
 		 433 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  31.83 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  32.18 
 
 		 423 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  31.51 
 
 		 428 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  32.34 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  33.1 
 
 		 450 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  32.34 
 
 		 423 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  32.29 
 
 		 432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  31.49 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  31.97 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  28.7 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  31.64 
 
 		 442 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  32.29 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  31.82 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  31.77 
 
 		 432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.9 
 
 		 429 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  33.65 
 
 		 437 aa  199  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  31.54 
 
 		 442 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  33.02 
 
 		 439 aa  199  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  31.71 
 
 		 442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  31.71 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  31.69 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  31.69 
 
 		 437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  31.54 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  32.1 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  30.55 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  31.71 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  31.8 
 
 		 430 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  31.99 
 
 		 442 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  32.37 
 
 		 441 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  31.99 
 
 		 442 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  31.99 
 
 		 442 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  30.73 
 
 		 427 aa  196  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  29.82 
 
 		 450 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>