More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3495 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  71.89 
 
 		 443 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  71.89 
 
 		 443 aa  656    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  80.09 
 
 		 435 aa  708    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  96.32 
 
 		 435 aa  842    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  71.89 
 
 		 443 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  81.19 
 
 		 436 aa  742    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  100 
 
 		 435 aa  893    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  70.02 
 
 		 439 aa  625  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  66.74 
 
 		 450 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  67.52 
 
 		 450 aa  611  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  67.38 
 
 		 446 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  68.81 
 
 		 450 aa  597  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  65.89 
 
 		 450 aa  600  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  67.24 
 
 		 449 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  67.73 
 
 		 449 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  66.99 
 
 		 444 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  66.83 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  60.97 
 
 		 448 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  61.38 
 
 		 443 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  59.68 
 
 		 442 aa  520  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  56.94 
 
 		 441 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  57.52 
 
 		 442 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  55.35 
 
 		 446 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  57.11 
 
 		 442 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  53.83 
 
 		 445 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  56.45 
 
 		 446 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  56.45 
 
 		 446 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  51.92 
 
 		 446 aa  438  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  49.45 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  51.58 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  50.48 
 
 		 439 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  50.73 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  50.73 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  50.73 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  49.31 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  49.02 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  46.62 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  47.78 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  46.35 
 
 		 454 aa  362  6e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  44.91 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  42.22 
 
 		 450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  44.3 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  35.73 
 
 		 420 aa  302  6.000000000000001e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  35.66 
 
 		 415 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  32.95 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  33.79 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  33.67 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  35.45 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  33.03 
 
 		 436 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  33.79 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  33.66 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  33.85 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  31.69 
 
 		 425 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  34.99 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  34.19 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  32.99 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  34.82 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  34.01 
 
 		 439 aa  237  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  33.26 
 
 		 427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  33.73 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  33.59 
 
 		 441 aa  236  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  34.34 
 
 		 421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  33.79 
 
 		 474 aa  233  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.89 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  30.05 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  32.3 
 
 		 422 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.3 
 
 		 422 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  33.96 
 
 		 408 aa  232  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  35.88 
 
 		 435 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  31.36 
 
 		 442 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  33.11 
 
 		 433 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  32.88 
 
 		 433 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  34.77 
 
 		 441 aa  229  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  33.02 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  35.15 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  32.6 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  31.51 
 
 		 428 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  34.51 
 
 		 431 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  34.13 
 
 		 434 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  32.67 
 
 		 403 aa  226  9e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  31.92 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.3 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.78 
 
 		 428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  34.51 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.39 
 
 		 435 aa  223  7e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  34.07 
 
 		 431 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  34.07 
 
 		 431 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  33.25 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  34.07 
 
 		 431 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  33.51 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  34.07 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  35.82 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  33.03 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  33.57 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  33.63 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  32.75 
 
 		 433 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  32.75 
 
 		 431 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  32.75 
 
 		 433 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>