More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4760 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  73.77 
 
 		 442 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  100 
 
 		 446 aa  897    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  78.24 
 
 		 445 aa  700    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  75.36 
 
 		 442 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  98.88 
 
 		 446 aa  890    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  100 
 
 		 446 aa  897    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  56.57 
 
 		 450 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  56.31 
 
 		 448 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  56.94 
 
 		 462 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  53.83 
 
 		 450 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  54.25 
 
 		 436 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  54.9 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  54.11 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  56.22 
 
 		 444 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  56.45 
 
 		 450 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  53.72 
 
 		 450 aa  472  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  53.65 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  53.88 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  56.09 
 
 		 435 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  55.5 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  55.26 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  54.72 
 
 		 446 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  52.97 
 
 		 435 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  49.66 
 
 		 439 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  48.58 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  47.62 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  47.63 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  47.11 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  46.54 
 
 		 461 aa  358  8e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  47.02 
 
 		 439 aa  355  6.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  45.12 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  47 
 
 		 444 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  47 
 
 		 444 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  46.76 
 
 		 444 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  45.14 
 
 		 462 aa  341  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  40.35 
 
 		 469 aa  335  9e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  44.6 
 
 		 445 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  40.22 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  41.65 
 
 		 451 aa  305  9.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  42.13 
 
 		 454 aa  296  5e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  38.95 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  37.35 
 
 		 450 aa  279  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  34.43 
 
 		 420 aa  256  8e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  34.29 
 
 		 435 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  31.21 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  33.02 
 
 		 442 aa  229  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  33.02 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  32.7 
 
 		 426 aa  227  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  33.09 
 
 		 415 aa  220  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  32.85 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  32.07 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  34.88 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  33.25 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  34.88 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  34.88 
 
 		 463 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  34.84 
 
 		 431 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.01 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  32.01 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  29.78 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  31.7 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  34.59 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  34.63 
 
 		 463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  32.48 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  34.59 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  34.15 
 
 		 431 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  29.21 
 
 		 432 aa  213  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  32.85 
 
 		 414 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.49 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  31.55 
 
 		 433 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  34.63 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  34.4 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  31.32 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  31.99 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  33.91 
 
 		 431 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  31.99 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  34.15 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  30.46 
 
 		 443 aa  210  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  32.7 
 
 		 424 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  32.2 
 
 		 430 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  32.86 
 
 		 439 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  34.24 
 
 		 431 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  33.42 
 
 		 431 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  31.73 
 
 		 438 aa  208  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  30.83 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  31.63 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  30.64 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  33.41 
 
 		 439 aa  206  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  34.39 
 
 		 431 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  31.98 
 
 		 432 aa  206  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  30.31 
 
 		 441 aa  206  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  31.02 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  32.93 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  30.68 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.56 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  30.68 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  30.68 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  32.69 
 
 		 432 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  30.73 
 
 		 450 aa  203  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  28.84 
 
 		 421 aa  203  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>