More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1017 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  74.29 
 
 		 451 aa  683    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  100 
 
 		 461 aa  941    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  62.2 
 
 		 454 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  61.86 
 
 		 439 aa  532  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  48.05 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  45.94 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  45.7 
 
 		 444 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  42.79 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  47.55 
 
 		 446 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  45.21 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  45.62 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  44.72 
 
 		 449 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  45.62 
 
 		 443 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  43.98 
 
 		 450 aa  352  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  45.36 
 
 		 443 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  43.48 
 
 		 450 aa  349  6e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  43.25 
 
 		 462 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  44.5 
 
 		 450 aa  347  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  44.52 
 
 		 446 aa  346  5e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  45.17 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  44.91 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  44.69 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  43.95 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  43.53 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  39.21 
 
 		 448 aa  330  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  44.01 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  43.1 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  43.1 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  42.86 
 
 		 444 aa  323  6e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  45.77 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  40.04 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  42.36 
 
 		 441 aa  316  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  41.83 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  41.83 
 
 		 446 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  41.83 
 
 		 446 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  43.16 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  43.42 
 
 		 442 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  42.28 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  42.18 
 
 		 453 aa  299  5e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  39.86 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  36.21 
 
 		 469 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  40.76 
 
 		 462 aa  279  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  34.76 
 
 		 420 aa  241  1e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  36 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  32.76 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  34.48 
 
 		 427 aa  223  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  33.74 
 
 		 434 aa  223  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  33.77 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  34.65 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.76 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  31 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  31.4 
 
 		 421 aa  216  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  33.01 
 
 		 432 aa  216  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  33.16 
 
 		 421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  31.75 
 
 		 450 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  33.74 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  31.93 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  30.02 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  31.93 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  33.83 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.83 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  31.37 
 
 		 438 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  33.76 
 
 		 432 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  33.86 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  31.28 
 
 		 425 aa  206  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  32.77 
 
 		 428 aa  206  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  31.85 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  32.83 
 
 		 431 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.16 
 
 		 430 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  33.07 
 
 		 427 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  32.83 
 
 		 431 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  32.73 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  32.33 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  32.73 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  32.12 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  33.76 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  31.98 
 
 		 435 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  32.12 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  32.12 
 
 		 431 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  30.87 
 
 		 436 aa  199  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.88 
 
 		 407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  33.53 
 
 		 429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  31.58 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  32.08 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  31.87 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.59 
 
 		 407 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  32.9 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  32.75 
 
 		 434 aa  192  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  32.59 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  31.42 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  31.42 
 
 		 431 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  31.42 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  34.42 
 
 		 434 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  31.67 
 
 		 430 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  31.67 
 
 		 430 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  32.41 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  30.83 
 
 		 463 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  31.58 
 
 		 424 aa  189  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  31.07 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  34.42 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>