294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0926 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  100 
 
 		 1075 aa  2221    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  33.27 
 
 		 1167 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  39.63 
 
 		 1079 aa  789    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  29.68 
 
 		 1104 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  29 
 
 		 1117 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1059 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  29.09 
 
 		 1089 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  28.57 
 
 		 1069 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  27.36 
 
 		 1097 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  26.89 
 
 		 1065 aa  403  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  27.07 
 
 		 1092 aa  395  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1051 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  26.74 
 
 		 1094 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  26.75 
 
 		 1093 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  27.05 
 
 		 1093 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  26.75 
 
 		 1093 aa  386  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  27.09 
 
 		 1094 aa  386  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  26.43 
 
 		 1094 aa  382  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  27.02 
 
 		 1104 aa  380  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  27.27 
 
 		 1084 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  26.6 
 
 		 1094 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  26.7 
 
 		 1094 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  26.56 
 
 		 1094 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  26.7 
 
 		 1094 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  28.32 
 
 		 1107 aa  361  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  26.99 
 
 		 1147 aa  361  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  27.5 
 
 		 1016 aa  360  9.999999999999999e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  25.16 
 
 		 1094 aa  350  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  26.86 
 
 		 1008 aa  325  3e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  29.79 
 
 		 1183 aa  322  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  29.87 
 
 		 1181 aa  307  7e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  25.48 
 
 		 1067 aa  302  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.85 
 
 		 1082 aa  298  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25.43 
 
 		 1090 aa  298  5e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  24.36 
 
 		 1186 aa  292  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.42 
 
 		 1097 aa  277  8e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  25.94 
 
 		 1076 aa  270  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  25.9 
 
 		 1084 aa  269  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  25.43 
 
 		 1354 aa  194  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  26.54 
 
 		 1545 aa  150  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  26.54 
 
 		 1545 aa  150  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  28.25 
 
 		 1125 aa  148  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  22.83 
 
 		 1193 aa  131  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  27.09 
 
 		 969 aa  114  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  25.99 
 
 		 425 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  24.54 
 
 		 1484 aa  101  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  24.75 
 
 		 428 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  22.63 
 
 		 1062 aa  89  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  22.63 
 
 		 1062 aa  89  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.44 
 
 		 1005 aa  89  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  22.54 
 
 		 1069 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  22.8 
 
 		 1062 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  22.74 
 
 		 1081 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  22.52 
 
 		 1078 aa  82.8  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  21.95 
 
 		 1067 aa  81.3  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  23.25 
 
 		 427 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  21.29 
 
 		 1062 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  23.2 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  22.33 
 
 		 1071 aa  78.6  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  21.38 
 
 		 1066 aa  77  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  23.45 
 
 		 1060 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  21.37 
 
 		 1062 aa  77  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  21.24 
 
 		 1062 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  21.37 
 
 		 1062 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  21.23 
 
 		 1062 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  22.32 
 
 		 1065 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  35.34 
 
 		 567 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  20.61 
 
 		 1049 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  27.06 
 
 		 572 aa  70.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  20.45 
 
 		 1059 aa  68.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  23.91 
 
 		 1014 aa  68.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  22.03 
 
 		 1062 aa  65.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  26.38 
 
 		 717 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  21.57 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  23.81 
 
 		 432 aa  63.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  20.58 
 
 		 1040 aa  63.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  20.4 
 
 		 1042 aa  62.4  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  22.84 
 
 		 427 aa  62  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.93 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  21.75 
 
 		 429 aa  61.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  22.6 
 
 		 482 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.62 
 
 		 1138 aa  61.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  25.51 
 
 		 642 aa  60.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  25.18 
 
 		 734 aa  60.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  25.75 
 
 		 410 aa  60.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  34.42 
 
 		 419 aa  60.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.55 
 
 		 362 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  22.45 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  27.37 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  27.37 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  27.37 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  27.37 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  27.37 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1042 aa  58.9  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 		 888 aa  58.9  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  21.43 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.59 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  25 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.08 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>