More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1717 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  100 
 
 		 1040 aa  2059    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  38.58 
 
 		 1005 aa  680    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  96.55 
 
 		 1042 aa  1943    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  98.56 
 
 		 1042 aa  1966    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  51.18 
 
 		 1059 aa  899    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  47 
 
 		 1031 aa  767    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  39.26 
 
 		 1014 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  37.06 
 
 		 1010 aa  535  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  27.47 
 
 		 1138 aa  235  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  25.75 
 
 		 1067 aa  233  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  25.54 
 
 		 1060 aa  231  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  25.88 
 
 		 1049 aa  228  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  27.72 
 
 		 1062 aa  228  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  26.57 
 
 		 1062 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  25.24 
 
 		 1062 aa  227  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  25.24 
 
 		 1062 aa  224  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  25.43 
 
 		 1062 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  25.36 
 
 		 1062 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  25.17 
 
 		 1062 aa  221  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  24.98 
 
 		 1062 aa  220  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  25.19 
 
 		 1062 aa  217  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  25.31 
 
 		 1065 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.77 
 
 		 1066 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  25.35 
 
 		 1078 aa  214  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.37 
 
 		 1069 aa  214  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.81 
 
 		 1081 aa  211  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  24.46 
 
 		 1071 aa  208  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  23.84 
 
 		 1084 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  23.9 
 
 		 1111 aa  178  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  23.7 
 
 		 1113 aa  166  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  23.34 
 
 		 1052 aa  162  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  29.06 
 
 		 445 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  24.57 
 
 		 598 aa  108  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  24.63 
 
 		 1090 aa  108  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  27.4 
 
 		 686 aa  108  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  26.63 
 
 		 1097 aa  106  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  35.71 
 
 		 572 aa  96.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  28.82 
 
 		 1125 aa  96.3  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  25.81 
 
 		 445 aa  96.3  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  41.55 
 
 		 457 aa  95.9  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  24.45 
 
 		 1082 aa  95.1  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.79 
 
 		 459 aa  95.1  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  34.83 
 
 		 567 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  31.17 
 
 		 444 aa  92.8  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 		 969 aa  92.8  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.77 
 
 		 430 aa  91.7  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  31.17 
 
 		 444 aa  91.3  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  31.17 
 
 		 444 aa  91.3  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.41 
 
 		 590 aa  90.1  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  24.27 
 
 		 680 aa  90.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  24.14 
 
 		 354 aa  89  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  27.25 
 
 		 432 aa  87.8  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  24.12 
 
 		 717 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 441 aa  87  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  31.82 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  31.82 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.76 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  32.29 
 
 		 422 aa  84.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.29 
 
 		 422 aa  84.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  26.91 
 
 		 666 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  29.01 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1209  winged helix family two component response transcriptional regulator  22.2 
 
 		 714 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310847  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  26.89 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  26.89 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0847  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.56 
 
 		 700 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.704427  normal  0.802494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  26.89 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 		 642 aa  83.2  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  32.29 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  32.82 
 
 		 435 aa  83.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  30.65 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  26.89 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  28.81 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  28.81 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  28.81 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  32.65 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.4 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  27.35 
 
 		 451 aa  80.5  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  26.36 
 
 		 1167 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  29.76 
 
 		 442 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 442 aa  80.1  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  28.81 
 
 		 441 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.25 
 
 		 1028 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  30.05 
 
 		 441 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  26.85 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  27.88 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  36.81 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  34.81 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  26.4 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  30.33 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  29.91 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0612  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  26.75 
 
 		 590 aa  78.6  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  28 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  28.93 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  25.71 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  24.27 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  27.39 
 
 		 316 aa  77.4  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.13 
 
 		 444 aa  77.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.48 
 
 		 428 aa  77.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  26.8 
 
 		 441 aa  77.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  26.04 
 
 		 478 aa  77.4  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>