More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6483 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  100 
 
 		 1125 aa  2194    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  35.27 
 
 		 1084 aa  619  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  34.09 
 
 		 1076 aa  588  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  30.55 
 
 		 1067 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  29.48 
 
 		 1097 aa  357  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  27.58 
 
 		 1090 aa  325  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  27.56 
 
 		 1082 aa  323  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  26.85 
 
 		 1167 aa  277  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  25.73 
 
 		 1079 aa  274  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  24.95 
 
 		 1092 aa  232  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  25.11 
 
 		 1093 aa  232  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  25.11 
 
 		 1093 aa  229  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  25.4 
 
 		 1094 aa  226  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  25.02 
 
 		 1093 aa  227  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  25.18 
 
 		 1084 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  24.48 
 
 		 1094 aa  221  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  25.07 
 
 		 1094 aa  221  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  25.07 
 
 		 1094 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  23.99 
 
 		 1075 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  24.39 
 
 		 1094 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  24.89 
 
 		 1094 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  24.32 
 
 		 1094 aa  211  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  23.75 
 
 		 1094 aa  211  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  24.85 
 
 		 1097 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1059 aa  190  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  28.61 
 
 		 1193 aa  189  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  28.58 
 
 		 1069 aa  185  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  26.23 
 
 		 1104 aa  184  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  25.71 
 
 		 1016 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  26.07 
 
 		 1117 aa  171  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  29.89 
 
 		 1181 aa  158  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  32.81 
 
 		 1089 aa  150  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  29.73 
 
 		 1104 aa  148  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  27.69 
 
 		 1183 aa  140  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1051 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.21 
 
 		 1005 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  29.44 
 
 		 1107 aa  120  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  26.9 
 
 		 1186 aa  117  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  30.41 
 
 		 1147 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  26.8 
 
 		 1008 aa  110  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  31.63 
 
 		 1059 aa  108  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  25.25 
 
 		 1065 aa  108  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  25.99 
 
 		 1354 aa  100  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  28.82 
 
 		 1040 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  25.82 
 
 		 1545 aa  95.9  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  25.31 
 
 		 425 aa  95.9  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  26.22 
 
 		 1010 aa  95.9  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  29.13 
 
 		 1042 aa  95.9  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  25.82 
 
 		 1545 aa  94.7  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.53 
 
 		 717 aa  94  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  27.65 
 
 		 1062 aa  92.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1042 aa  90.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  26.58 
 
 		 1014 aa  90.1  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.28 
 
 		 1066 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  23.59 
 
 		 1067 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  25.78 
 
 		 1062 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  25.61 
 
 		 1062 aa  85.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  22.99 
 
 		 1113 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  25.35 
 
 		 1060 aa  84  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  25.56 
 
 		 1062 aa  84  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.37 
 
 		 1069 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  24.45 
 
 		 969 aa  82  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  26.24 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.49 
 
 		 1081 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  22.85 
 
 		 428 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  24.49 
 
 		 1062 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  28.37 
 
 		 1484 aa  79  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  24.48 
 
 		 1065 aa  79  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  24.7 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  24.03 
 
 		 1071 aa  78.2  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  24.19 
 
 		 1062 aa  78.2  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  24.56 
 
 		 1062 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  23.72 
 
 		 1062 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  28.16 
 
 		 430 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  23.72 
 
 		 1062 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  23.43 
 
 		 1049 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  28.16 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  28.16 
 
 		 430 aa  72  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  35.46 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  35.46 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  27.69 
 
 		 432 aa  70.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  25.06 
 
 		 465 aa  71.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.33 
 
 		 670 aa  71.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  27 
 
 		 442 aa  71.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.98 
 
 		 444 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.84 
 
 		 673 aa  70.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  35.71 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  26.15 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  28.51 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  27.27 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  39.45 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  26.22 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  38.18 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  29.03 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4122  carboxyl-terminal protease  27.3 
 
 		 697 aa  68.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.23 
 
 		 1138 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  27.27 
 
 		 442 aa  67.4  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.67 
 
 		 708 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0859  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  32.12 
 
 		 296 aa  67  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  21.59 
 
 		 1084 aa  67.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>