235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2556 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  100 
 
 		 483 aa  992    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  28.14 
 
 		 686 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  28.42 
 
 		 702 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  28.51 
 
 		 666 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  28.04 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  29.24 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  27.78 
 
 		 478 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  29.07 
 
 		 456 aa  120  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  27.75 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  26.57 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  26.5 
 
 		 680 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  27.29 
 
 		 540 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  27.33 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  27.31 
 
 		 451 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  24.89 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  25.85 
 
 		 543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  25.65 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  26.5 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  25.22 
 
 		 428 aa  107  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  28.17 
 
 		 1084 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  26.12 
 
 		 432 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  22.65 
 
 		 672 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  25.21 
 
 		 694 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  26.01 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  26.8 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  25.81 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  25.05 
 
 		 692 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  25.51 
 
 		 445 aa  99.8  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.05 
 
 		 434 aa  97.8  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  25 
 
 		 426 aa  97.8  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  24 
 
 		 422 aa  97.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  25.64 
 
 		 480 aa  97.1  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  25.11 
 
 		 485 aa  97.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  25.44 
 
 		 1062 aa  95.9  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  24.71 
 
 		 409 aa  95.9  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  24.34 
 
 		 1031 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  25.35 
 
 		 423 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  24.79 
 
 		 568 aa  93.6  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  24.89 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  26.6 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.93 
 
 		 1014 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  26.02 
 
 		 426 aa  91.3  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  30.61 
 
 		 407 aa  90.5  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  24.31 
 
 		 585 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  24.24 
 
 		 1052 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  25.78 
 
 		 1059 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.19 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  25.54 
 
 		 496 aa  87.8  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  25.85 
 
 		 1067 aa  87.4  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.11 
 
 		 437 aa  86.7  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.81 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  25.6 
 
 		 484 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  25.41 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1042 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  25.61 
 
 		 1042 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  26.84 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  23.02 
 
 		 1005 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  25.22 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  25.33 
 
 		 1040 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  25.4 
 
 		 1062 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  25.49 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  25.65 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.89 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.59 
 
 		 1081 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  24.62 
 
 		 1071 aa  79  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  23.43 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.28 
 
 		 1138 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.59 
 
 		 1069 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  24.44 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  24.61 
 
 		 1060 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  24.28 
 
 		 1062 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  24.59 
 
 		 1065 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  23.93 
 
 		 598 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  25.42 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  24.14 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  23.81 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  23.93 
 
 		 1062 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  22.52 
 
 		 819 aa  74.7  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  22.54 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  26.05 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  24.07 
 
 		 1078 aa  74.3  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  25.06 
 
 		 435 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  23.83 
 
 		 1062 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  32.64 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  28.46 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  27.17 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  23.58 
 
 		 1062 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  30.99 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  23.9 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  23.9 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  26.74 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  23.26 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  22.93 
 
 		 1066 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  23.94 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  26.47 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  23.77 
 
 		 1062 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  25 
 
 		 438 aa  70.1  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  24.83 
 
 		 1113 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  28.34 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>